RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LRRC37A3O60309 1634 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BCL9O00512 1426 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 QRICH2Q9H0J4 1663 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SBF2Q86WG5 1849 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STK32BQ9NY57 414 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EXOC5O00471 708 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TTC21AQ8NDW8 1320 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC7Q96M83 1385 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AKAP12Q02952 1782 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WNK3Q9BYP7 1800 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARHGEF25Q86VW2 580 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PIK3C2AO00443 1686 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CASZ1Q86V15 1759 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZBTB7AO95365 584 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABCC6O95255 1503 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COL18A1P39060 1754 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TXNRD1Q16881 649 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SOX12O15370 315 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC15A2Q16348 729 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MTFR1LQ9H019 292 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNS2Q63HR2 1409 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PROM2Q8N271 834 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PTGER2P43116 358 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PTF1AQ7RTS3 328 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYOM1P52179 1685 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NFAT5O94916 1531 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SYT17Q9BSW7 474 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 L3MBTL2Q969R5 705 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NLRP2Q9NX02 1062 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RGPD5Q99666 1765 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NHSQ6T4R5 1651 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ERBB3P21860 1342 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IL2RBP14784 551 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARXQ96QS3 562 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ACSBG1Q96GR2 724 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP31Q70CQ4 1352 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAP3K5Q99683 1374 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MON2Q7Z3U7 1717 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POLD1P28340 1107 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANKRD24Q8TF21 1146 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP54Q70EL1 1684 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHD4Q14839 1912 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPR162Q16538 588 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC27A3Q5K4L6 730 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PAPPAQ13219 1627 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NME9Q86XW9 330 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMC1Q8TDI8 760 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TERF2IPQ9NYB0 399 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BTAF1O14981 1849 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NEUROD1Q13562 356 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LTN1O94822 1766 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C1QTNF8P60827 252 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF827Q17R98 1081 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KLHL34Q8N239 644 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IP6K1Q92551 441 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AKT1S1Q96B36 256 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KAT6BQ8WYB5 2073 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 QSER1Q2KHR3 1735 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CD163L1Q9NR16 1453 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC24A1O60721 1099 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A0A1W2PP64 1363 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UTRNP46939 3433 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COG3Q96JB2 828 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms