RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
SH3BP2-212ENST00000508338 KIF24Q5T7B8 1368 aa36.64■■■■□ 3.46
SH3BP2-212ENST00000508338 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
SH3BP2-212ENST00000508338 RTL1A6NKG5 1358 aa36.63■■■■□ 3.45
SH3BP2-212ENST00000508338 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
SH3BP2-212ENST00000508338 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
SH3BP2-212ENST00000508338 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
SH3BP2-212ENST00000508338 MAP3K19Q56UN5 1328 aa36.59■■■■□ 3.45
SH3BP2-212ENST00000508338 MORC1Q86VD1 984 aa36.59■■■■□ 3.45
SH3BP2-212ENST00000508338 IP6K1Q92551 441 aa36.59■■■■□ 3.45
SH3BP2-212ENST00000508338 STRN4Q9NRL3 753 aa36.59■■■■□ 3.45
SH3BP2-212ENST00000508338 AMPHP49418 695 aa36.58■■■■□ 3.45
SH3BP2-212ENST00000508338 AXIN2Q9Y2T1 843 aa36.56■■■■□ 3.44
SH3BP2-212ENST00000508338 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.56■■■■□ 3.44
SH3BP2-212ENST00000508338 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.56■■■■□ 3.44
SH3BP2-212ENST00000508338 RGPD5Q99666 1765 aa36.55■■■■□ 3.44
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR17Q8IZU2 1322 aa36.54■■■■□ 3.44
SH3BP2-212ENST00000508338 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
SH3BP2-212ENST00000508338 CRB1P82279 1406 aa36.52■■■■□ 3.44
SH3BP2-212ENST00000508338 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
SH3BP2-212ENST00000508338 FLT4P35916 1363 aa36.52■■■■□ 3.44
SH3BP2-212ENST00000508338 HOXC9P31274 260 aa36.51■■■■□ 3.44
SH3BP2-212ENST00000508338 GLI3P10071 1580 aa36.51■■■■□ 3.44
SH3BP2-212ENST00000508338 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.51■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa36.5■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 ERBB3P21860 1342 aa36.49■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 FBLN1P23142 703 aa36.48■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.47■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD24Q8TF21 1146 aa36.46■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 INSRP06213 1382 aa36.45■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 POLKQ9UBT6 870 aa36.45■■■■□ 3.43
SH3BP2-212ENST00000508338 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
SH3BP2-212ENST00000508338 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.44■■■■□ 3.42
SH3BP2-212ENST00000508338 BARGINQ6ZT62 677 aa36.43■■■■□ 3.42
SH3BP2-212ENST00000508338 CARD10Q9BWT7 1032 aa36.43■■■■□ 3.42
SH3BP2-212ENST00000508338 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa36.43■■■■□ 3.42
SH3BP2-212ENST00000508338 ILDR2Q71H61 639 aa36.42■■■■□ 3.42
SH3BP2-212ENST00000508338 RGS12O14924 1447 aa36.41■■■■□ 3.42
SH3BP2-212ENST00000508338 PEAK1Q9H792 1746 aa36.4■■■■□ 3.42
SH3BP2-212ENST00000508338 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
SH3BP2-212ENST00000508338 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
SH3BP2-212ENST00000508338 USP35Q9P2H5 1018 aa36.38■■■■□ 3.41
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
SH3BP2-212ENST00000508338 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa36.36■■■■□ 3.41
SH3BP2-212ENST00000508338 NLRP2Q9NX02 1062 aa36.36■■■■□ 3.41
SH3BP2-212ENST00000508338 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
SH3BP2-212ENST00000508338 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.33■■■■□ 3.41
SH3BP2-212ENST00000508338 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36.32■■■■□ 3.41
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A0G2JS52 829 aa36.32■■■■□ 3.4
SH3BP2-212ENST00000508338 MYT1Q01538 1121 aa36.32■■■■□ 3.4
SH3BP2-212ENST00000508338 WNK3Q9BYP7 1800 aa36.27■■■■□ 3.4
SH3BP2-212ENST00000508338 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
SH3BP2-212ENST00000508338 MTHFSP49914 203 aa36.26■■■■□ 3.4
SH3BP2-212ENST00000508338 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
SH3BP2-212ENST00000508338 RALBP1Q15311 655 aa36.23■■■■□ 3.39
SH3BP2-212ENST00000508338 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.23■■■■□ 3.39
SH3BP2-212ENST00000508338 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.22■■■■□ 3.39
SH3BP2-212ENST00000508338 DISP2A7MBM2 1401 aa36.21■■■■□ 3.39
SH3BP2-212ENST00000508338 IL2RBP14784 551 aa36.21■■■■□ 3.39
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.21■■■■□ 3.39
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
SH3BP2-212ENST00000508338 NBPF6Q5VWK0 638 aa36.2■■■■□ 3.39
SH3BP2-212ENST00000508338 NBPF4Q96M43 638 aa36.2■■■■□ 3.39
SH3BP2-212ENST00000508338 RGPD2P0DJD1 1756 aa36.2■■■■□ 3.38
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP2R1AP30153 589 aa36.17■■■■□ 3.38
SH3BP2-212ENST00000508338 PDE3BQ13370 1112 aa36.17■■■■□ 3.38
SH3BP2-212ENST00000508338 DDB1Q16531 1140 aa36.17■■■■□ 3.38
SH3BP2-212ENST00000508338 CFAP53Q96M91 514 aa36.17■■■■□ 3.38
SH3BP2-212ENST00000508338 NCAPD2Q15021 1401 aa36.15■■■■□ 3.38
SH3BP2-212ENST00000508338 EXOC5O00471 708 aa36.14■■■■□ 3.38
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC37A3O60309 1634 aa36.14■■■■□ 3.38
SH3BP2-212ENST00000508338 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa36.13■■■■□ 3.37
SH3BP2-212ENST00000508338 EYA1Q99502 592 aa36.13■■■■□ 3.37
SH3BP2-212ENST00000508338 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa36.12■■■■□ 3.37
SH3BP2-212ENST00000508338 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
SH3BP2-212ENST00000508338 IGSF1Q8N6C5 1336 aa36.1■■■■□ 3.37
SH3BP2-212ENST00000508338 TNS2Q63HR2 1409 aa36.1■■■■□ 3.37
SH3BP2-212ENST00000508338 IL13P35225 146 aa36.1■■■■□ 3.37
SH3BP2-212ENST00000508338 SOCS7O14512 581 aa36.09■■■■□ 3.37
SH3BP2-212ENST00000508338 TATP17735 454 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
SH3BP2-212ENST00000508338 USHBP1Q8N6Y0 703 aa36.07■■■■□ 3.36
SH3BP2-212ENST00000508338 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa36.05■■■■□ 3.36
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM196AQ6ZSG2 479 aa36.04■■■■□ 3.36
SH3BP2-212ENST00000508338 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
SH3BP2-212ENST00000508338 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
SH3BP2-212ENST00000508338 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.03■■■■□ 3.36
SH3BP2-212ENST00000508338 MEGF6O75095 1541 aa36.03■■■■□ 3.36
SH3BP2-212ENST00000508338 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
SH3BP2-212ENST00000508338 NUDCQ9Y266 331 aa36.02■■■■□ 3.36
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC125Q86Z20 511 aa36■■■■□ 3.35
SH3BP2-212ENST00000508338 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
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