RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 PPFIA3O75145 1194 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 NR3C2P08235 984 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 FSHRP23945 695 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 RFC5P40937 340 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 NBPF14Q5TI25 921 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 CDK15Q96Q40 435 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 KCTD17Q8N5Z5 321 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 MEIOBQ8N635 442 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 USP17L8P0C7I0 530 aa5.23□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.23□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa5.23□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM151AQ8N4L1 468 aa5.23□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.23□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa5.23□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 ERFEQ4G0M1 354 aa5.22□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 OCSTAMPQ9BR26 566 aa5.22□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.22□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.22□□□□□ -1.57
PDE4D-211ENST00000504624 TTLL8A6PVC2 850 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 GDF11O95390 407 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 RAB15P59190 212 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 KCNMA1Q12791 1236 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 PDXDC2PQ6P474 469 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 ZBTB33Q86T24 672 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 SVOPQ8N4V2 548 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 DNMT3LQ9UJW3 386 aa5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 TRIM34Q9BYJ4 488 aa5.2□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.19□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 RASSF7Q02833 373 aa5.19□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 PTSQ03393 145 aa5.19□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 CBLBQ13191 982 aa5.19□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM259Q4ZIN3 620 aa5.19□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 ADAM32Q8TC27 787 aa5.19□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 GOPCQ9HD26 462 aa5.19□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 SNRKQ9NRH2 765 aa5.19□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa5.19□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.18□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 CDC14CA4D256 554 aa5.18□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 MARSP56192 900 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 PTK2Q05397 1052 aa5.18□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 SLC10A4Q96EP9 437 aa5.18□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.18□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 CCDC155Q8N6L0 562 aa5.17□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa5.17□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 ADAMTS8Q9UP79 889 aa5.17□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 MAP3K10Q02779 954 aa5.16□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 GPAT2Q6NUI2 795 aa5.16□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 SV2AQ7L0J3 742 aa5.16□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 AGBL1Q96MI9 1066 aa5.16□□□□□ -1.58
PDE4D-211ENST00000504624 IRS1P35568 1242 aa5.15□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 KRT76Q01546 638 aa5.15□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.15□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 SPINT1O43278 529 aa5.14□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 FBXO45P0C2W1 286 aa5.14□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 ADD1P35611 737 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 RELBQ01201 579 aa5.14□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 MTMR14Q8NCE2 650 aa5.14□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.14□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 ERVH48-1M5A8F1 160 aa5.13□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 ITGA6P23229 1130 aa5.13□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 IGHA1P01876 353 aa5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 GSK3AP49840 483 aa5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 KANK3Q6NY19 840 aa5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 Q6ZVU0 165 aa5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 PNMA1Q8ND90 353 aa5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 ENAMQ9NRM1 1142 aa5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 GPSM3Q9Y4H4 160 aa5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 ZBBXA8MT70 800 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms