RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498562.2

CUL4A-211, Transcript of cullin 4A, humanhuman

TSL 3

Gene CUL4A, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4A-211ENST00000498562 ARHGEF25Q86VW2 580 aa36.87■■■■□ 3.49
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CUL4A-211ENST00000498562 TONSLQ96HA7 1378 aa36.86■■■■□ 3.49
CUL4A-211ENST00000498562 USP54Q70EL1 1684 aa36.86■■■■□ 3.49
CUL4A-211ENST00000498562 NUP188Q5SRE5 1749 aa36.85■■■■□ 3.49
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CUL4A-211ENST00000498562 OVOS2Q6IE36 1432 aa36.82■■■■□ 3.48
CUL4A-211ENST00000498562 ABCC6O95255 1503 aa36.81■■■■□ 3.48
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CUL4A-211ENST00000498562 DDB1Q16531 1140 aa36.76■■■■□ 3.48
CUL4A-211ENST00000498562 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.74■■■■□ 3.47
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CUL4A-211ENST00000498562 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa36.73■■■■□ 3.47
CUL4A-211ENST00000498562 CARD10Q9BWT7 1032 aa36.71■■■■□ 3.47
CUL4A-211ENST00000498562 LTN1O94822 1766 aa36.71■■■■□ 3.47
CUL4A-211ENST00000498562 TMC1Q8TDI8 760 aa36.7■■■■□ 3.47
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CUL4A-211ENST00000498562 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.68■■■■□ 3.46
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CUL4A-211ENST00000498562 TESK2Q96S53 571 aa36.61■■■■□ 3.45
CUL4A-211ENST00000498562 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.61■■■■□ 3.45
CUL4A-211ENST00000498562 ERBB3P21860 1342 aa36.6■■■■□ 3.45
CUL4A-211ENST00000498562 TNS2Q63HR2 1409 aa36.59■■■■□ 3.45
CUL4A-211ENST00000498562 PTF1AQ7RTS3 328 aa36.59■■■■□ 3.45
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CUL4A-211ENST00000498562 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.56■■■■□ 3.44
CUL4A-211ENST00000498562 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.56■■■■□ 3.44
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CUL4A-211ENST00000498562 NHSQ6T4R5 1651 aa36.49■■■■□ 3.43
CUL4A-211ENST00000498562 NLRP2Q9NX02 1062 aa36.49■■■■□ 3.43
CUL4A-211ENST00000498562 ANKRD24Q8TF21 1146 aa36.48■■■■□ 3.43
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CUL4A-211ENST00000498562 TXNRD1Q16881 649 aa36.37■■■■□ 3.41
CUL4A-211ENST00000498562 ACSBG1Q96GR2 724 aa36.34■■■■□ 3.41
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CUL4A-211ENST00000498562 MAP3K19Q56UN5 1328 aa36.34■■■■□ 3.41
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CUL4A-211ENST00000498562 FBLN1P23142 703 aa36.29■■■■□ 3.4
CUL4A-211ENST00000498562 PAPPAQ13219 1627 aa36.28■■■■□ 3.4
CUL4A-211ENST00000498562 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
CUL4A-211ENST00000498562 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
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CUL4A-211ENST00000498562 RTL1A6NKG5 1358 aa36.26■■■■□ 3.39
CUL4A-211ENST00000498562 MYOM1P52179 1685 aa36.26■■■■□ 3.39
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CUL4A-211ENST00000498562 SHANK3Q9BYB0 1731 aa36.25■■■■□ 3.39
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CUL4A-211ENST00000498562 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
CUL4A-211ENST00000498562 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
CUL4A-211ENST00000498562 NBPF6Q5VWK0 638 aa36.1■■■■□ 3.37
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CUL4A-211ENST00000498562 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.09■■■■□ 3.37
CUL4A-211ENST00000498562 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF827Q17R98 1081 aa36.08■■■■□ 3.37
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