RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	NLRP7	Q8WX94	980 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	RGS20	O76081	388 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	PTPRN	Q16849	979 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	BRICD5	Q6PL45	260 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBXN4-208	ENST00000490163	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.59	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	ATP2B4	P23634	1241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	PLCG2	P16885	1265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	IGFBP4	P22692	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	MPND	Q8N594	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	POTEB2	H3BUK9	544 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	POTEJ	P0CG39	1038 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	ATP6V1A	P38606	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	PSME1	Q06323	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	GJD3	Q8N144	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	FOXO3	O43524	673 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	FZD6	O60353	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	GJA8	P48165	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	PACS2	Q86VP3	889 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	JUND	P17535	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	MYO19	Q96H55	970 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	FGR	P09769	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	SERPINB4	P48594	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	RELT	Q969Z4	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	KCNB2	Q92953	911 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	MTFR1	Q15390	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163		Q3C1V9	767 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	HLA-C	Q95604	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	TMC7	Q7Z402	723 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBXN4-208	ENST00000490163	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBXN4-208	ENST00000490163	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBXN4-208	ENST00000490163	CTSH	P09668	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBXN4-208	ENST00000490163	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UBXN4-208	ENST00000490163	RFX1	P22670	979 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBXN4-208	ENST00000490163	HSD3B2	P26439	372 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBXN4-208	ENST00000490163	GUCA2A	Q02747	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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