RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 ABCC6O95255 1503 aa29.3■■■□□ 2.28
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HOXD10-202ENST00000490088 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD10-202ENST00000490088 HOXC9P31274 260 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD10-202ENST00000490088 IP6K1Q92551 441 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD10-202ENST00000490088 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD10-202ENST00000490088 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXD10-202ENST00000490088 RTL1A6NKG5 1358 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD10-202ENST00000490088 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD10-202ENST00000490088 NRAPQ86VF7 1730 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD10-202ENST00000490088 FLT4P35916 1363 aa29.27■■■□□ 2.28
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HOXD10-202ENST00000490088 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.26■■■□□ 2.28
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HOXD10-202ENST00000490088 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.24■■■□□ 2.27
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HOXD10-202ENST00000490088 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.22■■■□□ 2.27
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HOXD10-202ENST00000490088 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD10-202ENST00000490088 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
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HOXD10-202ENST00000490088 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
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HOXD10-202ENST00000490088 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
HOXD10-202ENST00000490088 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD10-202ENST00000490088 ANP32CO43423 234 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD10-202ENST00000490088 POTEAQ6S8J7 498 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD10-202ENST00000490088 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD10-202ENST00000490088 CRB1P82279 1406 aa29.14■■■□□ 2.26
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HOXD10-202ENST00000490088 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD10-202ENST00000490088 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD10-202ENST00000490088 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD10-202ENST00000490088 USP35Q9P2H5 1018 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD10-202ENST00000490088 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
HOXD10-202ENST00000490088 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD10-202ENST00000490088 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXD10-202ENST00000490088 GLI3P10071 1580 aa29.09■■■□□ 2.25
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HOXD10-202ENST00000490088 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
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HOXD10-202ENST00000490088 NBPF4Q96M43 638 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD10-202ENST00000490088 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD10-202ENST00000490088 IL13P35225 146 aa29.06■■■□□ 2.24
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HOXD10-202ENST00000490088 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXD10-202ENST00000490088 RXRBP28702 533 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD10-202ENST00000490088 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD10-202ENST00000490088 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD10-202ENST00000490088 EYA1Q99502 592 aa29.04■■■□□ 2.24
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HOXD10-202ENST00000490088 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXD10-202ENST00000490088 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD10-202ENST00000490088 BARGINQ6ZT62 677 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD10-202ENST00000490088 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD10-202ENST00000490088 NCAPD2Q15021 1401 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD10-202ENST00000490088 A0A0G2JS52 829 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD10-202ENST00000490088 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
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HOXD10-202ENST00000490088 DISP2A7MBM2 1401 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 CCDC184Q52MB2 194 aa28.94■■■□□ 2.22
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HOXD10-202ENST00000490088 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 IL2RBP14784 551 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.93■■■□□ 2.22
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HOXD10-202ENST00000490088 RGS12O14924 1447 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 MEGF6O75095 1541 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 HMOX1P09601 288 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
HOXD10-202ENST00000490088 KDRP35968 1356 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXD10-202ENST00000490088 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
HOXD10-202ENST00000490088 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
HOXD10-202ENST00000490088 MRS2Q9HD23 443 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD10-202ENST00000490088 LRRC37A3O60309 1634 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD10-202ENST00000490088 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXD10-202ENST00000490088 DDB1Q16531 1140 aa28.84■■■□□ 2.21
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