RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.08■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 ARXQ96QS3 562 aa23.08■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.08■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 GPR162Q16538 588 aa23.07■■□□□ 1.28
SRPRB-204ENST00000484684 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.07■■□□□ 1.28
SRPRB-204ENST00000484684 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SRPRB-204ENST00000484684 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.06■■□□□ 1.28
SRPRB-204ENST00000484684 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SRPRB-204ENST00000484684 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.05■■□□□ 1.28
SRPRB-204ENST00000484684 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.04■■□□□ 1.28
SRPRB-204ENST00000484684 BCL9O00512 1426 aa23.03■■□□□ 1.28
SRPRB-204ENST00000484684 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SRPRB-204ENST00000484684 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.01■■□□□ 1.27
SRPRB-204ENST00000484684 MAP3K5Q99683 1374 aa23.01■■□□□ 1.27
SRPRB-204ENST00000484684 AKAP12Q02952 1782 aa23.01■■□□□ 1.27
SRPRB-204ENST00000484684 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SRPRB-204ENST00000484684 KLHL34Q8N239 644 aa22.99■■□□□ 1.27
SRPRB-204ENST00000484684 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.98■■□□□ 1.27
SRPRB-204ENST00000484684 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.98■■□□□ 1.27
SRPRB-204ENST00000484684 CEP350Q5VT06 3117 aa22.97■■□□□ 1.27
SRPRB-204ENST00000484684 NLRP6P59044 892 aa22.97■■□□□ 1.27
SRPRB-204ENST00000484684 EXOC5O00471 708 aa22.95■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.95■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 STAC3Q96MF2 364 aa22.95■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.94■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.93■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 SLIT3O75094 1523 aa22.92■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.91■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 POLD1P28340 1107 aa22.9■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.9■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.9■■□□□ 1.26
SRPRB-204ENST00000484684 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 COL18A1P39060 1754 aa22.89■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF827Q17R98 1081 aa22.88■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 PAPPAQ13219 1627 aa22.88■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 USP6P35125 1406 aa22.88■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 NHSQ6T4R5 1651 aa22.87■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 CABP2Q9NPB3 220 aa22.87■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 TNS2Q63HR2 1409 aa22.87■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.86■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC7Q96M83 1385 aa22.85■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 SOX12O15370 315 aa22.84■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.84■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.83■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 CABP1Q9NZU7 370 aa22.83■■□□□ 1.25
SRPRB-204ENST00000484684 GRIN3BO60391 1043 aa22.82■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.82■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.82■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 PIK3C2AO00443 1686 aa22.81■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 RGPD5Q99666 1765 aa22.81■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.8■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.79■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 ATP10DQ9P241 1426 aa22.79■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 ABCC6O95255 1503 aa22.78■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 BTAF1O14981 1849 aa22.78■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 AKT1S1Q96B36 256 aa22.78■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.77■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 HSPA6P17066 643 aa22.77■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SRPRB-204ENST00000484684 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.76■■□□□ 1.23
SRPRB-204ENST00000484684 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.76■■□□□ 1.23
SRPRB-204ENST00000484684 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.74■■□□□ 1.23
SRPRB-204ENST00000484684 IL2RBP14784 551 aa22.73■■□□□ 1.23
SRPRB-204ENST00000484684 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.73■■□□□ 1.23
SRPRB-204ENST00000484684 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.73■■□□□ 1.23
SRPRB-204ENST00000484684 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.73■■□□□ 1.23
SRPRB-204ENST00000484684 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.72■■□□□ 1.23
SRPRB-204ENST00000484684 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.72■■□□□ 1.23
SRPRB-204ENST00000484684 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.71■■□□□ 1.23
SRPRB-204ENST00000484684 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.7■■□□□ 1.23
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SRPRB-204ENST00000484684 NFAT5O94916 1531 aa22.69■■□□□ 1.22
SRPRB-204ENST00000484684 MSH5O43196 834 aa22.68■■□□□ 1.22
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SRPRB-204ENST00000484684 ERBB3P21860 1342 aa22.67■■□□□ 1.22
SRPRB-204ENST00000484684 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.67■■□□□ 1.22
SRPRB-204ENST00000484684 KCNQ4P56696 695 aa22.67■■□□□ 1.22
SRPRB-204ENST00000484684 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.65■■□□□ 1.22
SRPRB-204ENST00000484684 EVC2Q86UK5 1308 aa22.64■■□□□ 1.22
SRPRB-204ENST00000484684 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SRPRB-204ENST00000484684 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SRPRB-204ENST00000484684 ADCY9O60503 1353 aa22.62■■□□□ 1.21
SRPRB-204ENST00000484684 MSL1Q68DK7 614 aa22.61■■□□□ 1.21
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.61■■□□□ 1.21
SRPRB-204ENST00000484684 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SRPRB-204ENST00000484684 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SRPRB-204ENST00000484684 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SRPRB-204ENST00000484684 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SRPRB-204ENST00000484684 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SRPRB-204ENST00000484684 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.57■■□□□ 1.2
SRPRB-204ENST00000484684 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.55■■□□□ 1.2
SRPRB-204ENST00000484684 APLP1P51693 650 aa22.54■■□□□ 1.2
SRPRB-204ENST00000484684 LTN1O94822 1766 aa22.53■■□□□ 1.2
SRPRB-204ENST00000484684 LY75O60449 1722 aa22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms