RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484571.5

VWA3B-215, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 3

Gene VWA3B, Length 717 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-215ENST00000484571 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.87■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.87■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.86■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 NME9Q86XW9 330 aa28.85■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.85■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.85■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 PDE3BQ13370 1112 aa28.84■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.84■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 BAG6P46379 1132 aa28.83■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.83■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.83■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.83■■■□□ 2.21
VWA3B-215ENST00000484571 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
VWA3B-215ENST00000484571 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.81■■■□□ 2.2
VWA3B-215ENST00000484571 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
VWA3B-215ENST00000484571 DISP2A7MBM2 1401 aa28.81■■■□□ 2.2
VWA3B-215ENST00000484571 SOX12O15370 315 aa28.8■■■□□ 2.2
VWA3B-215ENST00000484571 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.79■■■□□ 2.2
VWA3B-215ENST00000484571 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.79■■■□□ 2.2
VWA3B-215ENST00000484571 CCDC7Q96M83 1385 aa28.76■■■□□ 2.2
VWA3B-215ENST00000484571 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.75■■■□□ 2.19
VWA3B-215ENST00000484571 FAM182BQ5T319 152 aa28.75■■■□□ 2.19
VWA3B-215ENST00000484571 COG3Q96JB2 828 aa28.74■■■□□ 2.19
VWA3B-215ENST00000484571 ERBB3P21860 1342 aa28.72■■■□□ 2.19
VWA3B-215ENST00000484571 DDB1Q16531 1140 aa28.72■■■□□ 2.19
VWA3B-215ENST00000484571 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.72■■■□□ 2.19
VWA3B-215ENST00000484571 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.7■■■□□ 2.19
VWA3B-215ENST00000484571 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
VWA3B-215ENST00000484571 LRRC37A3O60309 1634 aa28.69■■■□□ 2.18
VWA3B-215ENST00000484571 LTN1O94822 1766 aa28.68■■■□□ 2.18
VWA3B-215ENST00000484571 TRIM37O94972 964 aa28.68■■■□□ 2.18
VWA3B-215ENST00000484571 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.68■■■□□ 2.18
VWA3B-215ENST00000484571 BCL9O00512 1426 aa28.68■■■□□ 2.18
VWA3B-215ENST00000484571 RGPD5Q99666 1765 aa28.67■■■□□ 2.18
VWA3B-215ENST00000484571 IP6K1Q92551 441 aa28.67■■■□□ 2.18
VWA3B-215ENST00000484571 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.18
VWA3B-215ENST00000484571 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
VWA3B-215ENST00000484571 FYB1O15117 783 aa28.64■■■□□ 2.18
VWA3B-215ENST00000484571 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.64■■■□□ 2.18
VWA3B-215ENST00000484571 PEAK1Q9H792 1746 aa28.63■■■□□ 2.17
VWA3B-215ENST00000484571 RTL1A6NKG5 1358 aa28.62■■■□□ 2.17
VWA3B-215ENST00000484571 EXOC5O00471 708 aa28.62■■■□□ 2.17
VWA3B-215ENST00000484571 APBA3O96018 575 aa28.62■■■□□ 2.17
VWA3B-215ENST00000484571 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.62■■■□□ 2.17
VWA3B-215ENST00000484571 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.61■■■□□ 2.17
VWA3B-215ENST00000484571 MYOM1P52179 1685 aa28.61■■■□□ 2.17
VWA3B-215ENST00000484571 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.6■■■□□ 2.17
VWA3B-215ENST00000484571 TNS2Q63HR2 1409 aa28.6■■■□□ 2.17
VWA3B-215ENST00000484571 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
VWA3B-215ENST00000484571 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.58■■■□□ 2.17
VWA3B-215ENST00000484571 IL2RBP14784 551 aa28.57■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 AMPHP49418 695 aa28.57■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.57■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 HOXC9P31274 260 aa28.56■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.55■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.55■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.53■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.52■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 PLSCR1O15162 318 aa28.52■■■□□ 2.16
VWA3B-215ENST00000484571 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.51■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.51■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 RREB1Q92766 1687 aa28.49■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 SBF2Q86WG5 1849 aa28.48■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 INSRP06213 1382 aa28.47■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 FLT4P35916 1363 aa28.47■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 FBLN1P23142 703 aa28.46■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 NBPF14Q5TI25 921 aa28.46■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
VWA3B-215ENST00000484571 LRP5O75197 1615 aa28.43■■■□□ 2.14
VWA3B-215ENST00000484571 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
VWA3B-215ENST00000484571 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.41■■■□□ 2.14
VWA3B-215ENST00000484571 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
VWA3B-215ENST00000484571 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.41■■■□□ 2.14
VWA3B-215ENST00000484571 NHSQ6T4R5 1651 aa28.38■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 NSD2O96028 1365 aa28.38■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.37■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.36■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 NBPF4Q96M43 638 aa28.36■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.35■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 PANK3Q9H999 370 aa28.35■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.35■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.34■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.33■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.33■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 MEGF6O75095 1541 aa28.33■■■□□ 2.13
VWA3B-215ENST00000484571 KCNQ2O43526 872 aa28.31■■■□□ 2.12
VWA3B-215ENST00000484571 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
VWA3B-215ENST00000484571 NCAPD2Q15021 1401 aa28.3■■■□□ 2.12
VWA3B-215ENST00000484571 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
VWA3B-215ENST00000484571 TXNRD1Q16881 649 aa28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms