RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482429.1

LTB-212, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 2

Gene LTB, Length 1,388 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-212ENST00000482429 CASZ1Q86V15 1759 aa29.78■■■□□ 2.36
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LTB-212ENST00000482429 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.77■■■□□ 2.36
LTB-212ENST00000482429 CABP1Q9NZU7 370 aa29.77■■■□□ 2.36
LTB-212ENST00000482429 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.76■■■□□ 2.35
LTB-212ENST00000482429 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
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LTB-212ENST00000482429 PIK3C2AO00443 1686 aa29.74■■■□□ 2.35
LTB-212ENST00000482429 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.74■■■□□ 2.35
LTB-212ENST00000482429 AKAP12Q02952 1782 aa29.73■■■□□ 2.35
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LTB-212ENST00000482429 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.65■■■□□ 2.34
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LTB-212ENST00000482429 MYOM1P52179 1685 aa29.62■■■□□ 2.33
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LTB-212ENST00000482429 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.6■■■□□ 2.33
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LTB-212ENST00000482429 NEUROD1Q13562 356 aa29.38■■■□□ 2.29
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LTB-212ENST00000482429 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.33■■■□□ 2.29
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LTB-212ENST00000482429 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.22■■■□□ 2.27
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LTB-212ENST00000482429 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.19■■■□□ 2.26
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LTB-212ENST00000482429 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.16■■■□□ 2.26
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