RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481995.5

HOXB-AS3-211, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 523 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-211ENST00000481995 USP19O94966 1318 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-211ENST00000481995 AKAP12Q02952 1782 aa18.88■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GCP02774 474 aa18.88■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-211ENST00000481995 STK32BQ9NY57 414 aa18.88■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CHD4Q14839 1912 aa18.88■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-211ENST00000481995 WNK3Q9BYP7 1800 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PLEKHG3A1L390 1219 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PTGER2P43116 358 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SYT17Q9BSW7 474 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 C1QTNF8P60827 252 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NLRP6P59044 892 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PTF1AQ7RTS3 328 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 MTFR1LQ9H019 292 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SLC15A2Q16348 729 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TXNRD1Q16881 649 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NBPF1Q3BBV0 1214 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PROM2Q8N271 834 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 WDR17Q8IZU2 1322 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SLIT3O75094 1523 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-211ENST00000481995 BCL9O00512 1426 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GPR162Q16538 588 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ARXQ96QS3 562 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 EXOC5O00471 708 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CABP2Q9NPB3 220 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 USP6P35125 1406 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 COL18A1P39060 1754 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 RGPD5Q99666 1765 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 IFFO2Q5TF58 517 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 KLHL34Q8N239 644 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PIK3C2AO00443 1686 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NHSQ6T4R5 1651 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SOX12O15370 315 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CARD10Q9BWT7 1032 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 AXIN2Q9Y2T1 843 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 UTRNP46939 3433 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SGIP1Q9BQI5 828 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CABP1Q9NZU7 370 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ACSBG1Q96GR2 724 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CCDC7Q96M83 1385 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 MAP3K5Q99683 1374 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TNS2Q63HR2 1409 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 USP47Q96K76 1375 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 POLD1P28340 1107 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PAPPAQ13219 1627 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ARHGEF25Q86VW2 580 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 BTAF1O14981 1849 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ABCC6O95255 1503 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ZNF827Q17R98 1081 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-211ENST00000481995 EVC2Q86UK5 1308 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NLRP2Q9NX02 1062 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SLC16A10Q8TF71 515 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TESK2Q96S53 571 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-211ENST00000481995 QSER1Q2KHR3 1735 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SHANK3Q9BYB0 1731 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-211ENST00000481995 IL2RBP14784 551 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NFAT5O94916 1531 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 LRRC4BQ9NT99 713 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GRIN3BO60391 1043 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 LTN1O94822 1766 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ERBB3P21860 1342 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 AKT1S1Q96B36 256 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 MSH5O43196 834 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-211ENST00000481995 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.52■□□□□ 0.55
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
HOXB-AS3-211ENST00000481995 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ANKRD24Q8TF21 1146 aa18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms