RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.84■■■□□ 2.21
NELFE-208ENST00000481121 A0A0G2JS52 829 aa28.84■■■□□ 2.21
NELFE-208ENST00000481121 MYT1Q01538 1121 aa28.84■■■□□ 2.21
NELFE-208ENST00000481121 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
NELFE-208ENST00000481121 COG3Q96JB2 828 aa28.84■■■□□ 2.21
NELFE-208ENST00000481121 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.82■■■□□ 2.2
NELFE-208ENST00000481121 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
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NELFE-208ENST00000481121 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.81■■■□□ 2.2
NELFE-208ENST00000481121 CRB1P82279 1406 aa28.81■■■□□ 2.2
NELFE-208ENST00000481121 USP35Q9P2H5 1018 aa28.79■■■□□ 2.2
NELFE-208ENST00000481121 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.78■■■□□ 2.2
NELFE-208ENST00000481121 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.78■■■□□ 2.2
NELFE-208ENST00000481121 FYB1O15117 783 aa28.77■■■□□ 2.2
NELFE-208ENST00000481121 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
NELFE-208ENST00000481121 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.77■■■□□ 2.2
NELFE-208ENST00000481121 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
NELFE-208ENST00000481121 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
NELFE-208ENST00000481121 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
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NELFE-208ENST00000481121 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.73■■■□□ 2.19
NELFE-208ENST00000481121 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.73■■■□□ 2.19
NELFE-208ENST00000481121 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.72■■■□□ 2.19
NELFE-208ENST00000481121 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.71■■■□□ 2.19
NELFE-208ENST00000481121 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
NELFE-208ENST00000481121 BARGINQ6ZT62 677 aa28.71■■■□□ 2.19
NELFE-208ENST00000481121 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
NELFE-208ENST00000481121 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.71■■■□□ 2.19
NELFE-208ENST00000481121 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.7■■■□□ 2.19
NELFE-208ENST00000481121 LRRC37A3O60309 1634 aa28.7■■■□□ 2.18
NELFE-208ENST00000481121 ERBB3P21860 1342 aa28.68■■■□□ 2.18
NELFE-208ENST00000481121 PANK3Q9H999 370 aa28.68■■■□□ 2.18
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.67■■■□□ 2.18
NELFE-208ENST00000481121 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
NELFE-208ENST00000481121 RTL1A6NKG5 1358 aa28.66■■■□□ 2.18
NELFE-208ENST00000481121 PEAK1Q9H792 1746 aa28.65■■■□□ 2.18
NELFE-208ENST00000481121 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.65■■■□□ 2.18
NELFE-208ENST00000481121 FBLN1P23142 703 aa28.64■■■□□ 2.18
NELFE-208ENST00000481121 IP6K1Q92551 441 aa28.64■■■□□ 2.17
NELFE-208ENST00000481121 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.63■■■□□ 2.17
NELFE-208ENST00000481121 AMPHP49418 695 aa28.63■■■□□ 2.17
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.63■■■□□ 2.17
NELFE-208ENST00000481121 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.63■■■□□ 2.17
NELFE-208ENST00000481121 CCDC7Q96M83 1385 aa28.62■■■□□ 2.17
NELFE-208ENST00000481121 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
NELFE-208ENST00000481121 HOXC9P31274 260 aa28.61■■■□□ 2.17
NELFE-208ENST00000481121 NSD2O96028 1365 aa28.59■■■□□ 2.17
NELFE-208ENST00000481121 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.58■■■□□ 2.17
NELFE-208ENST00000481121 DISP2A7MBM2 1401 aa28.58■■■□□ 2.17
NELFE-208ENST00000481121 PDE3BQ13370 1112 aa28.57■■■□□ 2.16
NELFE-208ENST00000481121 FAM182BQ5T319 152 aa28.57■■■□□ 2.16
NELFE-208ENST00000481121 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.57■■■□□ 2.16
NELFE-208ENST00000481121 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
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NELFE-208ENST00000481121 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.56■■■□□ 2.16
NELFE-208ENST00000481121 CCDC125Q86Z20 511 aa28.56■■■□□ 2.16
NELFE-208ENST00000481121 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
NELFE-208ENST00000481121 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
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NELFE-208ENST00000481121 DDB1Q16531 1140 aa28.53■■■□□ 2.16
NELFE-208ENST00000481121 SBF2Q86WG5 1849 aa28.52■■■□□ 2.16
NELFE-208ENST00000481121 INSRP06213 1382 aa28.51■■■□□ 2.16
NELFE-208ENST00000481121 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.51■■■□□ 2.15
NELFE-208ENST00000481121 TNS2Q63HR2 1409 aa28.51■■■□□ 2.15
NELFE-208ENST00000481121 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.49■■■□□ 2.15
NELFE-208ENST00000481121 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
NELFE-208ENST00000481121 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.48■■■□□ 2.15
NELFE-208ENST00000481121 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
NELFE-208ENST00000481121 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
NELFE-208ENST00000481121 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.47■■■□□ 2.15
NELFE-208ENST00000481121 IL2RBP14784 551 aa28.46■■■□□ 2.15
NELFE-208ENST00000481121 MORC1Q86VD1 984 aa28.44■■■□□ 2.14
NELFE-208ENST00000481121 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
NELFE-208ENST00000481121 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.43■■■□□ 2.14
NELFE-208ENST00000481121 EXOC5O00471 708 aa28.43■■■□□ 2.14
NELFE-208ENST00000481121 POLKQ9UBT6 870 aa28.43■■■□□ 2.14
NELFE-208ENST00000481121 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
NELFE-208ENST00000481121 MEGF6O75095 1541 aa28.39■■■□□ 2.14
NELFE-208ENST00000481121 TRIM37O94972 964 aa28.39■■■□□ 2.14
NELFE-208ENST00000481121 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.39■■■□□ 2.14
NELFE-208ENST00000481121 NBPF4Q96M43 638 aa28.39■■■□□ 2.14
NELFE-208ENST00000481121 BAG6P46379 1132 aa28.38■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.38■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.37■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 BCL9O00512 1426 aa28.36■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 NHSQ6T4R5 1651 aa28.36■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.34■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.34■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.33■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.33■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 NCAPD2Q15021 1401 aa28.33■■■□□ 2.13
NELFE-208ENST00000481121 RREB1Q92766 1687 aa28.32■■■□□ 2.12
NELFE-208ENST00000481121 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.31■■■□□ 2.12
NELFE-208ENST00000481121 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.31■■■□□ 2.12
NELFE-208ENST00000481121 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
NELFE-208ENST00000481121 APBA3O96018 575 aa28.28■■■□□ 2.12
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