RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 TCP11L2Q8N4U5 519 aa33.64■■■□□ 2.98
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PTPRD-210ENST00000481079 FAM182BQ5T319 152 aa33.62■■■□□ 2.97
PTPRD-210ENST00000481079 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
PTPRD-210ENST00000481079 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa33.61■■■□□ 2.97
PTPRD-210ENST00000481079 OVOS2Q6IE36 1432 aa33.61■■■□□ 2.97
PTPRD-210ENST00000481079 ABCC6O95255 1503 aa33.6■■■□□ 2.97
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.59■■■□□ 2.97
PTPRD-210ENST00000481079 WDR17Q8IZU2 1322 aa33.57■■■□□ 2.97
PTPRD-210ENST00000481079 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
PTPRD-210ENST00000481079 LTN1O94822 1766 aa33.55■■■□□ 2.96
PTPRD-210ENST00000481079 DEFB132Q7Z7B7 95 aa33.55■■■□□ 2.96
PTPRD-210ENST00000481079 MYOM1P52179 1685 aa33.52■■■□□ 2.96
PTPRD-210ENST00000481079 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa33.52■■■□□ 2.96
PTPRD-210ENST00000481079 RGPD1P0DJD0 1748 aa33.52■■■□□ 2.96
PTPRD-210ENST00000481079 WNK3Q9BYP7 1800 aa33.51■■■□□ 2.96
PTPRD-210ENST00000481079 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.95
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PTPRD-210ENST00000481079 FAM196AQ6ZSG2 479 aa33.47■■■□□ 2.95
PTPRD-210ENST00000481079 CARD10Q9BWT7 1032 aa33.46■■■□□ 2.95
PTPRD-210ENST00000481079 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa33.45■■■□□ 2.94
PTPRD-210ENST00000481079 DISP2A7MBM2 1401 aa33.44■■■□□ 2.94
PTPRD-210ENST00000481079 ERBB3P21860 1342 aa33.43■■■□□ 2.94
PTPRD-210ENST00000481079 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa33.42■■■□□ 2.94
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PTPRD-210ENST00000481079 PEAK1Q9H792 1746 aa33.42■■■□□ 2.94
PTPRD-210ENST00000481079 FYB1O15117 783 aa33.41■■■□□ 2.94
PTPRD-210ENST00000481079 BAG6P46379 1132 aa33.41■■■□□ 2.94
PTPRD-210ENST00000481079 TRIM37O94972 964 aa33.39■■■□□ 2.94
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC7Q96M83 1385 aa33.38■■■□□ 2.93
PTPRD-210ENST00000481079 CARD14Q9BXL6 1004 aa33.38■■■□□ 2.93
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PTPRD-210ENST00000481079 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.37■■■□□ 2.93
PTPRD-210ENST00000481079 DDB1Q16531 1140 aa33.37■■■□□ 2.93
PTPRD-210ENST00000481079 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
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PTPRD-210ENST00000481079 IP6K1Q92551 441 aa33.36■■■□□ 2.93
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.35■■■□□ 2.93
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PTPRD-210ENST00000481079 MAP3K19Q56UN5 1328 aa33.34■■■□□ 2.93
PTPRD-210ENST00000481079 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa33.33■■■□□ 2.93
PTPRD-210ENST00000481079 NSD3Q9BZ95 1437 aa33.31■■■□□ 2.92
PTPRD-210ENST00000481079 SBF2Q86WG5 1849 aa33.3■■■□□ 2.92
PTPRD-210ENST00000481079 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
PTPRD-210ENST00000481079 NLRP2Q9NX02 1062 aa33.3■■■□□ 2.92
PTPRD-210ENST00000481079 CAMKK2Q96RR4 588 aa33.29■■■□□ 2.92
PTPRD-210ENST00000481079 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
PTPRD-210ENST00000481079 HOXC9P31274 260 aa33.28■■■□□ 2.92
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PTPRD-210ENST00000481079 BCL9O00512 1426 aa33.27■■■□□ 2.92
PTPRD-210ENST00000481079 APBA3O96018 575 aa33.26■■■□□ 2.91
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PTPRD-210ENST00000481079 EXOC5O00471 708 aa33.23■■■□□ 2.91
PTPRD-210ENST00000481079 AMPHP49418 695 aa33.23■■■□□ 2.91
PTPRD-210ENST00000481079 RREB1Q92766 1687 aa33.22■■■□□ 2.91
PTPRD-210ENST00000481079 PARD3Q8TEW0 1356 aa33.21■■■□□ 2.91
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PTPRD-210ENST00000481079 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
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PTPRD-210ENST00000481079 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.2■■■□□ 2.91
PTPRD-210ENST00000481079 PTF1AQ7RTS3 328 aa33.18■■■□□ 2.9
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PTPRD-210ENST00000481079 NUP188Q5SRE5 1749 aa33.15■■■□□ 2.9
PTPRD-210ENST00000481079 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
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PTPRD-210ENST00000481079 KIF24Q5T7B8 1368 aa33.14■■■□□ 2.9
PTPRD-210ENST00000481079 INSRP06213 1382 aa33.12■■■□□ 2.89
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PTPRD-210ENST00000481079 PLSCR1O15162 318 aa33.09■■■□□ 2.89
PTPRD-210ENST00000481079 NBPF6Q5VWK0 638 aa33.09■■■□□ 2.89
PTPRD-210ENST00000481079 NBPF4Q96M43 638 aa33.09■■■□□ 2.89
PTPRD-210ENST00000481079 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa33.09■■■□□ 2.89
PTPRD-210ENST00000481079 NHSQ6T4R5 1651 aa33.08■■■□□ 2.89
PTPRD-210ENST00000481079 MEGF6O75095 1541 aa33.07■■■□□ 2.88
PTPRD-210ENST00000481079 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
PTPRD-210ENST00000481079 SHANK3Q9BYB0 1731 aa33.05■■■□□ 2.88
PTPRD-210ENST00000481079 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
PTPRD-210ENST00000481079 KCNQ2O43526 872 aa33.05■■■□□ 2.88
PTPRD-210ENST00000481079 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
PTPRD-210ENST00000481079 USHBP1Q8N6Y0 703 aa33.02■■■□□ 2.88
PTPRD-210ENST00000481079 KIF7Q2M1P5 1343 aa33.01■■■□□ 2.87
PTPRD-210ENST00000481079 LRP5O75197 1615 aa33■■■□□ 2.87
PTPRD-210ENST00000481079 PROM2Q8N271 834 aa33■■■□□ 2.87
PTPRD-210ENST00000481079 ACSBG1Q96GR2 724 aa33■■■□□ 2.87
PTPRD-210ENST00000481079 POLKQ9UBT6 870 aa33■■■□□ 2.87
PTPRD-210ENST00000481079 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.99■■■□□ 2.87
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