RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479495.5

QARS-215, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 4

Gene QARS, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-215	ENST00000479495	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		13.26	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.25	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	USP19	O94966	1318 aa		13.25	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	GPR162	Q16538	588 aa		13.25	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.25	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	CDK19	Q9BWU1	502 aa		13.25	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.25	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.24	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	ARX	Q96QS3	562 aa		13.24	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		13.24	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.23	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		13.22	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.22	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.22	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
QARS-215	ENST00000479495	BCL9	O00512	1426 aa		13.21	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.2	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.2	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		13.2	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.2	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	COL18A1	P39060	1754 aa		13.18	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	EXOC5	O00471	708 aa		13.18	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	NLRP6	P59044	892 aa		13.18	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.18	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.18	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.17	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.16	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.16	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.16	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	SLIT3	O75094	1523 aa		13.15	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.15	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		13.15	□□□□□ -0.3
QARS-215	ENST00000479495	POLD1	P28340	1107 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	BTAF1	O14981	1849 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	USP6	P35125	1406 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	TNS2	Q63HR2	1409 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	GRIN3B	O60391	1043 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	SOX12	O15370	315 aa		13.09	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	CABP1	Q9NZU7	370 aa		13.09	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		13.09	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.09	□□□□□ -0.31
QARS-215	ENST00000479495	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.07	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	HSPA6	P17066	643 aa		13.07	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	ABCC6	O95255	1503 aa		13.07	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	AKT1S1	Q96B36	256 aa		13.06	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.06	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	ATP10D	Q9P241	1426 aa		13.05	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	13.05	□□□□□ -0.32	1e-8	■□□□□ 10.9
QARS-215	ENST00000479495	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.05	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.04	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.04	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	IL2RB	P14784	551 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-215	ENST00000479495	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	MSH5	O43196	834 aa		13.01	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		13.01	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	NFAT5	O94916	1531 aa		13.01	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	LTN1	O94822	1766 aa		13.01	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	ERBB3	P21860	1342 aa		12.99	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	EVC2	Q86UK5	1308 aa		12.99	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	KCNQ4	P56696	695 aa		12.99	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	LY75	O60449	1722 aa		12.99	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		12.97	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	ADCY9	O60503	1353 aa		12.96	□□□□□ -0.33
QARS-215	ENST00000479495	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		12.96	□□□□□ -0.34
QARS-215	ENST00000479495	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
QARS-215	ENST00000479495	MSL1	Q68DK7	614 aa		12.95	□□□□□ -0.34
QARS-215	ENST00000479495	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
QARS-215	ENST00000479495	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
QARS-215	ENST00000479495	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		12.95	□□□□□ -0.34
QARS-215	ENST00000479495	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
QARS-215	ENST00000479495	APLP1	P51693	650 aa		12.94	□□□□□ -0.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms