RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18.49■□□□□ 0.55
PRAME-211ENST00000476336 OVOS2Q6IE36 1432 aa18.49■□□□□ 0.55
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PRAME-211ENST00000476336 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
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PRAME-211ENST00000476336 INSRP06213 1382 aa18.28■□□□□ 0.52
PRAME-211ENST00000476336 LRRC37A3O60309 1634 aa18.27■□□□□ 0.52
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PRAME-211ENST00000476336 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PRAME-211ENST00000476336 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-211ENST00000476336 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-211ENST00000476336 APBA3O96018 575 aa18.25■□□□□ 0.51
PRAME-211ENST00000476336 BCL9O00512 1426 aa18.24■□□□□ 0.51
PRAME-211ENST00000476336 FBLN1P23142 703 aa18.24■□□□□ 0.51
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PRAME-211ENST00000476336 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PRAME-211ENST00000476336 TNS2Q63HR2 1409 aa18.23■□□□□ 0.51
PRAME-211ENST00000476336 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.23■□□□□ 0.51
PRAME-211ENST00000476336 MORC1Q86VD1 984 aa18.22■□□□□ 0.51
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PRAME-211ENST00000476336 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.2■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.19■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 SBF2Q86WG5 1849 aa18.19■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 RGPD2P0DJD1 1756 aa18.19■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 RREB1Q92766 1687 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 NBPF14Q5TI25 921 aa18.17■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 NBPF6Q5VWK0 638 aa18.16■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 NBPF4Q96M43 638 aa18.16■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa18.16■□□□□ 0.5
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