RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476070.1

CERKL-211, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 4

Gene CERKL, Length 572 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-211ENST00000476070 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 USP35Q9P2H5 1018 aa18.2■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.19■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 AXIN2Q9Y2T1 843 aa18.19■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 DEFB132Q7Z7B7 95 aa18.18■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 TMC1Q8TDI8 760 aa18.18■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.18■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.17■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 USP47Q96K76 1375 aa18.17■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 SOX12O15370 315 aa18.17■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 NME9Q86XW9 330 aa18.17■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 ABCB7O75027 752 aa18.16■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 ARHGEF25Q86VW2 580 aa18.16■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 WNK3Q9BYP7 1800 aa18.16■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 USP31Q70CQ4 1352 aa18.16■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 EVA1CP58658 441 aa18.15■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 CCDC125Q86Z20 511 aa18.15■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 LTN1O94822 1766 aa18.14■□□□□ 0.5
CERKL-211ENST00000476070 BARGINQ6ZT62 677 aa18.14■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 CRB1P82279 1406 aa18.14■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 LRRC37A3O60309 1634 aa18.13■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 RGPD1P0DJD0 1748 aa18.13■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18.13■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 OVOS2Q6IE36 1432 aa18.13■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 TCP11L2Q8N4U5 519 aa18.12■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.12■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 MYOM1P52179 1685 aa18.12■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 PEAK1Q9H792 1746 aa18.1■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.09■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 WDR17Q8IZU2 1322 aa18.08■□□□□ 0.49
CERKL-211ENST00000476070 TERF2IPQ9NYB0 399 aa18.08■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.08■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 ABCC6O95255 1503 aa18.08■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.06■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 FBLN1P23142 703 aa18.06■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa18.06■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 DISP2A7MBM2 1401 aa18.06■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.05■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 TRIM37O94972 964 aa18.05■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 TMF1P82094 1093 aa18.04■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 SBF2Q86WG5 1849 aa18.03■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 ERBB3P21860 1342 aa18.02■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 PDE3BQ13370 1112 aa18.02■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 FAM196AQ6ZSG2 479 aa18.02■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
CERKL-211ENST00000476070 RREB1Q92766 1687 aa18.01■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 KIF20BQ96Q89 1820 aa18■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 BAG6P46379 1132 aa18■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 PTF1AQ7RTS3 328 aa18■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 CARD10Q9BWT7 1032 aa18■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 RGPD2P0DJD1 1756 aa17.99■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 CAMKK2Q96RR4 588 aa17.99■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 NUP188Q5SRE5 1749 aa17.98■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 FYB1O15117 783 aa17.98■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 DDB1Q16531 1140 aa17.98■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 CARD14Q9BXL6 1004 aa17.98■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa17.98■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 SLC24A1O60721 1099 aa17.97■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 GGNBP2Q9H3C7 697 aa17.97■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 MAP3K19Q56UN5 1328 aa17.97■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 ANKRD24Q8TF21 1146 aa17.96■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 COG3Q96JB2 828 aa17.96■□□□□ 0.47
CERKL-211ENST00000476070 CCDC7Q96M83 1385 aa17.95■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 APBA3O96018 575 aa17.95■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 IP6K1Q92551 441 aa17.95■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 TNS2Q63HR2 1409 aa17.95■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 NLRP2Q9NX02 1062 aa17.94■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 NSD3Q9BZ95 1437 aa17.94■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 HOXC9P31274 260 aa17.93■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 SHANK3Q9BYB0 1731 aa17.92■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 BCL9O00512 1426 aa17.91■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 CDCA8Q53HL2 280 aa17.91■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa17.91■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CERKL-211ENST00000476070 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CERKL-211ENST00000476070 NHSQ6T4R5 1651 aa17.89■□□□□ 0.45
CERKL-211ENST00000476070 LRP5O75197 1615 aa17.88■□□□□ 0.45
CERKL-211ENST00000476070 EXOC5O00471 708 aa17.88■□□□□ 0.45
CERKL-211ENST00000476070 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CERKL-211ENST00000476070 IL2RBP14784 551 aa17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms