RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-207ENST00000475558 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.62□□□□□ -0.87
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SHQ1-207ENST00000475558 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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SHQ1-207ENST00000475558 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.47□□□□□ -0.89
SHQ1-207ENST00000475558 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.47□□□□□ -0.89
SHQ1-207ENST00000475558 CRB1P82279 1406 aa9.47□□□□□ -0.89
SHQ1-207ENST00000475558 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.47□□□□□ -0.89
SHQ1-207ENST00000475558 DDB1Q16531 1140 aa9.46□□□□□ -0.9
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