RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 SOX12O15370 315 aa22.83■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 BARGINQ6ZT62 677 aa22.83■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-216ENST00000475195 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-216ENST00000475195 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-216ENST00000475195 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-216ENST00000475195 CRB1P82279 1406 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-216ENST00000475195 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.8■■□□□ 1.24
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ATG4B-216ENST00000475195 RGPD5Q99666 1765 aa22.78■■□□□ 1.24
ATG4B-216ENST00000475195 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.78■■□□□ 1.24
ATG4B-216ENST00000475195 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.78■■□□□ 1.24
ATG4B-216ENST00000475195 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.77■■□□□ 1.24
ATG4B-216ENST00000475195 IP6K1Q92551 441 aa22.77■■□□□ 1.24
ATG4B-216ENST00000475195 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.77■■□□□ 1.24
ATG4B-216ENST00000475195 LTN1O94822 1766 aa22.76■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 PANK3Q9H999 370 aa22.76■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 USP35Q9P2H5 1018 aa22.76■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.75■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 EP400Q96L91 3159 aa22.75■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.75■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.75■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 FBLN1P23142 703 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC125Q86Z20 511 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 ERBB3P21860 1342 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-216ENST00000475195 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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ATG4B-216ENST00000475195 MYT1Q01538 1121 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 RTL1A6NKG5 1358 aa22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC7Q96M83 1385 aa22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 AMPHP49418 695 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 DISP2A7MBM2 1401 aa22.65■■□□□ 1.22
ATG4B-216ENST00000475195 PDE3BQ13370 1112 aa22.64■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 NSD2O96028 1365 aa22.63■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.63■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.63■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 FAM182BQ5T319 152 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 INSRP06213 1382 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 DDB1Q16531 1140 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 POLKQ9UBT6 870 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.6■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 FLT4P35916 1363 aa22.6■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 PEAK1Q9H792 1746 aa22.6■■□□□ 1.21
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ATG4B-216ENST00000475195 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.59■■□□□ 1.21
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ATG4B-216ENST00000475195 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC37A3O60309 1634 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-216ENST00000475195 IL2RBP14784 551 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-216ENST00000475195 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.56■■□□□ 1.2
ATG4B-216ENST00000475195 NBPF4Q96M43 638 aa22.56■■□□□ 1.2
ATG4B-216ENST00000475195 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-216ENST00000475195 BCL9O00512 1426 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-216ENST00000475195 MORC1Q86VD1 984 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-216ENST00000475195 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-216ENST00000475195 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-216ENST00000475195 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-216ENST00000475195 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.51■■□□□ 1.19
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ATG4B-216ENST00000475195 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-216ENST00000475195 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-216ENST00000475195 TNS2Q63HR2 1409 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-216ENST00000475195 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-216ENST00000475195 TRIM37O94972 964 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-216ENST00000475195 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-216ENST00000475195 NCAPD2Q15021 1401 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4B-216ENST00000475195 BAG6P46379 1132 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4B-216ENST00000475195 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ATG4B-216ENST00000475195 SBF2Q86WG5 1849 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-216ENST00000475195 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 EYA1Q99502 592 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 APBA3O96018 575 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 MEGF6O75095 1541 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 PLSCR1O15162 318 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-216ENST00000475195 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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