RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472800.1

AUP1-207, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene AUP1, Length 663 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-207ENST00000472800 EP400Q96L91 3159 aa26.77■■□□□ 1.88
AUP1-207ENST00000472800 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.76■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.76■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.75■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.75■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 GLI3P10071 1580 aa26.75■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.74■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 FBLN1P23142 703 aa26.74■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 AMPHP49418 695 aa26.74■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 IP6K1Q92551 441 aa26.74■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 ABCC6O95255 1503 aa26.74■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 EVA1CP58658 441 aa26.73■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.72■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 VPS72Q15906 364 aa26.71■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 POLKQ9UBT6 870 aa26.71■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.71■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 RTL1A6NKG5 1358 aa26.71■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.7■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.7■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.7■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 COL18A1P39060 1754 aa26.69■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 HOXC9P31274 260 aa26.68■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.68■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.67■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 FLT4P35916 1363 aa26.66■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 LTN1O94822 1766 aa26.66■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 STRN4Q9NRL3 753 aa26.65■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 RALBP1Q15311 655 aa26.64■■□□□ 1.86
AUP1-207ENST00000472800 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.63■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 INSRP06213 1382 aa26.63■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.63■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.63■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.62■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 ERBB3P21860 1342 aa26.62■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 NRAPQ86VF7 1730 aa26.62■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.61■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.61■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.61■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.61■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.61■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.6■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 MTHFSP49914 203 aa26.6■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.59■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 CRB1P82279 1406 aa26.58■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 A0A0G2JS52 829 aa26.58■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 MYT1Q01538 1121 aa26.58■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.58■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 PPP2R1AP30153 589 aa26.57■■□□□ 1.84
AUP1-207ENST00000472800 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.57■■□□□ 1.84
AUP1-207ENST00000472800 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
AUP1-207ENST00000472800 PEAK1Q9H792 1746 aa26.55■■□□□ 1.84
AUP1-207ENST00000472800 RGPD5Q99666 1765 aa26.55■■□□□ 1.84
AUP1-207ENST00000472800 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
AUP1-207ENST00000472800 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.54■■□□□ 1.84
AUP1-207ENST00000472800 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.54■■□□□ 1.84
AUP1-207ENST00000472800 BARGINQ6ZT62 677 aa26.53■■□□□ 1.84
AUP1-207ENST00000472800 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
AUP1-207ENST00000472800 CFAP53Q96M91 514 aa26.5■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 USP35Q9P2H5 1018 aa26.5■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 BAG6P46379 1132 aa26.47■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.47■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 NBPF4Q96M43 638 aa26.47■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 ANP32CO43423 234 aa26.46■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 IL13P35225 146 aa26.46■■□□□ 1.83
AUP1-207ENST00000472800 EYA1Q99502 592 aa26.44■■□□□ 1.82
AUP1-207ENST00000472800 FAM182BQ5T319 152 aa26.42■■□□□ 1.82
AUP1-207ENST00000472800 IL2RBP14784 551 aa26.41■■□□□ 1.82
AUP1-207ENST00000472800 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
AUP1-207ENST00000472800 NUDCQ9Y266 331 aa26.4■■□□□ 1.82
AUP1-207ENST00000472800 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.39■■□□□ 1.82
AUP1-207ENST00000472800 NCAPD2Q15021 1401 aa26.39■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.37■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 DISP2A7MBM2 1401 aa26.37■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 EXOC5O00471 708 aa26.36■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.36■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 DDB1Q16531 1140 aa26.34■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.34■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.33■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms