RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468570.1

SGIP1-208, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, human

TSL 3

Gene SGIP1, Length 324 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGIP1-208	ENST00000468570	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	TSC1	Q92574	1164 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SGIP1-208	ENST00000468570	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	BAG6	P46379	1132 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	MAP3K10	Q02779	954 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	KRBA1	A5PL33	1030 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	FURIN	P09958	794 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	HRC	P23327	699 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	GJA5	P36382	358 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	RNF217	Q8TC41	542 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	ITGB7	P26010	798 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	LCE3B	Q5TA77	95 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	BCR	P11274	1271 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	ACD	Q96AP0	544 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SGIP1-208	ENST00000468570	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	PLCB2	Q00722	1185 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	IGF1R	P08069	1367 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	RELB	Q01201	579 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	QPCT	Q16769	361 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	COL8A1	P27658	744 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	ERFE	Q4G0M1	354 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	MBIP	Q9NS73	344 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	GPR25	O00155	361 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	DBN1	Q16643	649 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	RAB15	P59190	212 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	PODN	Q7Z5L7	613 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SGIP1-208	ENST00000468570	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	OIP5	O43482	229 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	LILRA1	O75019	489 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	AMHR2	Q16671	573 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	NBPF14	Q5TI25	921 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	GMCL1	Q96IK5	515 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	RHOQ	P17081	205 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	PTGIR	P43119	386 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	6.11	□□□□□ -1.43
SGIP1-208	ENST00000468570	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		6.11	□□□□□ -1.43

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