RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468077.5

TARBP1-204, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TARBP1, Length 514 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-204ENST00000468077 PIK3C2AO00443 1686 aa22.54■■□□□ 1.2
TARBP1-204ENST00000468077 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TARBP1-204ENST00000468077 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.52■■□□□ 1.2
TARBP1-204ENST00000468077 COL18A1P39060 1754 aa22.52■■□□□ 1.2
TARBP1-204ENST00000468077 MYOM1P52179 1685 aa22.52■■□□□ 1.2
TARBP1-204ENST00000468077 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TARBP1-204ENST00000468077 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.51■■□□□ 1.19
TARBP1-204ENST00000468077 UTRNP46939 3433 aa22.5■■□□□ 1.19
TARBP1-204ENST00000468077 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TARBP1-204ENST00000468077 BCL9O00512 1426 aa22.49■■□□□ 1.19
TARBP1-204ENST00000468077 CABP1Q9NZU7 370 aa22.49■■□□□ 1.19
TARBP1-204ENST00000468077 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.48■■□□□ 1.19
TARBP1-204ENST00000468077 ZBTB7AO95365 584 aa22.47■■□□□ 1.19
TARBP1-204ENST00000468077 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TARBP1-204ENST00000468077 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 STK32BQ9NY57 414 aa22.45■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.45■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.44■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.44■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 RGPD5Q99666 1765 aa22.43■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 PROM2Q8N271 834 aa22.43■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 TNS2Q63HR2 1409 aa22.42■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 PTGER2P43116 358 aa22.42■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 TXNRD1Q16881 649 aa22.42■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.42■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.42■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 EVC2Q86UK5 1308 aa22.41■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 SOX12O15370 315 aa22.41■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.41■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 ABCC6O95255 1503 aa22.41■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 CCDC7Q96M83 1385 aa22.4■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 NHSQ6T4R5 1651 aa22.4■■□□□ 1.18
TARBP1-204ENST00000468077 SLC15A2Q16348 729 aa22.39■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 NFAT5O94916 1531 aa22.39■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.38■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.37■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 EXOC5O00471 708 aa22.37■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 MTFR1LQ9H019 292 aa22.37■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 SYT17Q9BSW7 474 aa22.35■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 CHD4Q14839 1912 aa22.34■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 PAPPAQ13219 1627 aa22.34■■□□□ 1.17
TARBP1-204ENST00000468077 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.32■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 BTAF1O14981 1849 aa22.3■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.3■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.3■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 USP54Q70EL1 1684 aa22.29■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 ERBB3P21860 1342 aa22.29■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 MAP3K5Q99683 1374 aa22.28■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 ARXQ96QS3 562 aa22.28■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 LTN1O94822 1766 aa22.27■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.27■■□□□ 1.16
TARBP1-204ENST00000468077 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.26■■□□□ 1.15
TARBP1-204ENST00000468077 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.25■■□□□ 1.15
TARBP1-204ENST00000468077 IL2RBP14784 551 aa22.25■■□□□ 1.15
TARBP1-204ENST00000468077 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.25■■□□□ 1.15
TARBP1-204ENST00000468077 USP31Q70CQ4 1352 aa22.24■■□□□ 1.15
TARBP1-204ENST00000468077 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TARBP1-204ENST00000468077 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
TARBP1-204ENST00000468077 ZNF827Q17R98 1081 aa22.22■■□□□ 1.15
TARBP1-204ENST00000468077 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.2■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 C1QTNF8P60827 252 aa22.2■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 GPR162Q16538 588 aa22.19■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 KLHL34Q8N239 644 aa22.19■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.19■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 NME9Q86XW9 330 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 POLD1P28340 1107 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-204ENST00000468077 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 AKT1S1Q96B36 256 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 TMC1Q8TDI8 760 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 CEP350Q5VT06 3117 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.1■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 A0A1W2PP64 1363 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 NEUROD1Q13562 356 aa22.08■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.08■■□□□ 1.13
TARBP1-204ENST00000468077 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.08■■□□□ 1.12
TARBP1-204ENST00000468077 LY75O60449 1722 aa22.08■■□□□ 1.12
TARBP1-204ENST00000468077 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.08■■□□□ 1.12
TARBP1-204ENST00000468077 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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