RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 NME9Q86XW9 330 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRF-211ENST00000467464 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRF-211ENST00000467464 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.31e-6■□□□□ 9.3
PTPRF-211ENST00000467464 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 LRRC37A3O60309 1634 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 SOX12O15370 315 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 TRIM37O94972 964 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 TMC1Q8TDI8 760 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 PEAK1Q9H792 1746 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 PDE3BQ13370 1112 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 CAMKK2Q96RR4 588 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 USP47Q96K76 1375 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 CARD10Q9BWT7 1032 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRF-211ENST00000467464 WNK3Q9BYP7 1800 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 PARD3Q8TEW0 1356 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 BCL9O00512 1426 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 ERBB3P21860 1342 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 RREB1Q92766 1687 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 APBA3O96018 575 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 DDB1Q16531 1140 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC7Q96M83 1385 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 LRP5O75197 1615 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 RGPD5Q99666 1765 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 SLC24A1O60721 1099 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 TNS2Q63HR2 1409 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRF-211ENST00000467464 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 TMF1P82094 1093 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 LTN1O94822 1766 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 IP6K1Q92551 441 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 FBLN1P23142 703 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 MYOM1P52179 1685 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 FYB1O15117 783 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 COG3Q96JB2 828 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 EXOC5O00471 708 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 PLSCR1O15162 318 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRF-211ENST00000467464 SBF2Q86WG5 1849 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 HOXC9P31274 260 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 IL2RBP14784 551 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 PROM2Q8N271 834 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 RTL1A6NKG5 1358 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 CDCA8Q53HL2 280 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 KCNQ2O43526 872 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 NHSQ6T4R5 1651 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRF-211ENST00000467464 NBPF14Q5TI25 921 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 MEGF6O75095 1541 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 AMPHP49418 695 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 ACSBG1Q96GR2 724 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 INSRP06213 1382 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 TXNRD1Q16881 649 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 NBPF6Q5VWK0 638 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 NBPF4Q96M43 638 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 KIF24Q5T7B8 1368 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 FLT4P35916 1363 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 CASZ1Q86V15 1759 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 PAPPAQ13219 1627 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRF-211ENST00000467464 NCAPD2Q15021 1401 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRF-211ENST00000467464 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRF-211ENST00000467464 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PTPRF-211ENST00000467464 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRF-211ENST00000467464 NSD2O96028 1365 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRF-211ENST00000467464 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
PTPRF-211ENST00000467464 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRF-211ENST00000467464 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.62■□□□□ 0.25
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