RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466657.1

SIKE1-205, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIKE1, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-205ENST00000466657 TRIM37O94972 964 aa25.47■■□□□ 1.67
SIKE1-205ENST00000466657 PDE3BQ13370 1112 aa25.47■■□□□ 1.67
SIKE1-205ENST00000466657 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.47■■□□□ 1.67
SIKE1-205ENST00000466657 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SIKE1-205ENST00000466657 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.46■■□□□ 1.67
SIKE1-205ENST00000466657 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.46■■□□□ 1.67
SIKE1-205ENST00000466657 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.46■■□□□ 1.67
SIKE1-205ENST00000466657 USP31Q70CQ4 1352 aa25.45■■□□□ 1.67
SIKE1-205ENST00000466657 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.45■■□□□ 1.66
SIKE1-205ENST00000466657 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SIKE1-205ENST00000466657 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.42■■□□□ 1.66
SIKE1-205ENST00000466657 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SIKE1-205ENST00000466657 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SIKE1-205ENST00000466657 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SIKE1-205ENST00000466657 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.4■■□□□ 1.66
SIKE1-205ENST00000466657 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.4■■□□□ 1.66
SIKE1-205ENST00000466657 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.4■■□□□ 1.66
SIKE1-205ENST00000466657 APBA3O96018 575 aa25.39■■□□□ 1.66
SIKE1-205ENST00000466657 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.39■■□□□ 1.66
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SIKE1-205ENST00000466657 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
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SIKE1-205ENST00000466657 A0A1W2PP64 1363 aa25.36■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 TESK2Q96S53 571 aa25.36■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.36■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 DDB1Q16531 1140 aa25.35■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.35■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 NME9Q86XW9 330 aa25.34■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.33■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 SOX12O15370 315 aa25.33■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SIKE1-205ENST00000466657 CCDC7Q96M83 1385 aa25.32■■□□□ 1.64
SIKE1-205ENST00000466657 TMC1Q8TDI8 760 aa25.32■■□□□ 1.64
SIKE1-205ENST00000466657 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.31■■□□□ 1.64
SIKE1-205ENST00000466657 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SIKE1-205ENST00000466657 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.29■■□□□ 1.64
SIKE1-205ENST00000466657 SLC24A1O60721 1099 aa25.28■■□□□ 1.64
SIKE1-205ENST00000466657 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SIKE1-205ENST00000466657 ERBB3P21860 1342 aa25.28■■□□□ 1.64
SIKE1-205ENST00000466657 TNS2Q63HR2 1409 aa25.28■■□□□ 1.64
SIKE1-205ENST00000466657 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.27■■□□□ 1.64
SIKE1-205ENST00000466657 PLSCR1O15162 318 aa25.26■■□□□ 1.63
SIKE1-205ENST00000466657 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SIKE1-205ENST00000466657 NHSQ6T4R5 1651 aa25.25■■□□□ 1.63
SIKE1-205ENST00000466657 NBPF14Q5TI25 921 aa25.22■■□□□ 1.63
SIKE1-205ENST00000466657 EXOC5O00471 708 aa25.21■■□□□ 1.63
SIKE1-205ENST00000466657 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.21■■□□□ 1.63
SIKE1-205ENST00000466657 CASZ1Q86V15 1759 aa25.21■■□□□ 1.63
SIKE1-205ENST00000466657 USP47Q96K76 1375 aa25.2■■□□□ 1.63
SIKE1-205ENST00000466657 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.19■■□□□ 1.62
SIKE1-205ENST00000466657 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.19■■□□□ 1.62
SIKE1-205ENST00000466657 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.18■■□□□ 1.62
SIKE1-205ENST00000466657 MYOM1P52179 1685 aa25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-205ENST00000466657 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.17■■□□□ 1.62
SIKE1-205ENST00000466657 BTAF1O14981 1849 aa25.16■■□□□ 1.62
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SIKE1-205ENST00000466657 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.16■■□□□ 1.62
SIKE1-205ENST00000466657 IL2RBP14784 551 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-205ENST00000466657 PROM2Q8N271 834 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-205ENST00000466657 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.15■■□□□ 1.62
SIKE1-205ENST00000466657 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.14■■□□□ 1.61
SIKE1-205ENST00000466657 TMF1P82094 1093 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-205ENST00000466657 COG3Q96JB2 828 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-205ENST00000466657 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.13■■□□□ 1.61
SIKE1-205ENST00000466657 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-205ENST00000466657 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-205ENST00000466657 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-205ENST00000466657 PAPPAQ13219 1627 aa25.09■■□□□ 1.61
SIKE1-205ENST00000466657 RTL1A6NKG5 1358 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-205ENST00000466657 KCNQ2O43526 872 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-205ENST00000466657 HOXC9P31274 260 aa25.08■■□□□ 1.61
SIKE1-205ENST00000466657 FYB1O15117 783 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-205ENST00000466657 TXNRD1Q16881 649 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-205ENST00000466657 CDCA8Q53HL2 280 aa25.05■■□□□ 1.6
SIKE1-205ENST00000466657 SPON1Q9HCB6 807 aa25.05■■□□□ 1.6
SIKE1-205ENST00000466657 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.04■■□□□ 1.6
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SIKE1-205ENST00000466657 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.01■■□□□ 1.59
SIKE1-205ENST00000466657 LY75O60449 1722 aa25■■□□□ 1.59
SIKE1-205ENST00000466657 MEGF6O75095 1541 aa25■■□□□ 1.59
SIKE1-205ENST00000466657 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.99■■□□□ 1.59
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SIKE1-205ENST00000466657 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SIKE1-205ENST00000466657 STK32BQ9NY57 414 aa24.97■■□□□ 1.59
SIKE1-205ENST00000466657 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SIKE1-205ENST00000466657 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.96■■□□□ 1.59
SIKE1-205ENST00000466657 INSRP06213 1382 aa24.95■■□□□ 1.59
SIKE1-205ENST00000466657 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.94■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.94■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 NBPF4Q96M43 638 aa24.94■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
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