RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462996.1

PTPN18-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, human

TSL 4

Gene PTPN18, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN18-208	ENST00000462996	NLRP6	P59044	892 aa		29.41	■■■□□ 2.3
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	29.41	■■■□□ 2.3
PTPN18-208	ENST00000462996	CABP2	Q9NPB3	220 aa		29.41	■■■□□ 2.3
PTPN18-208	ENST00000462996	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	29.41	■■■□□ 2.3
PTPN18-208	ENST00000462996	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		29.4	■■■□□ 2.3
PTPN18-208	ENST00000462996	SLIT3	O75094	1523 aa		29.4	■■■□□ 2.3
PTPN18-208	ENST00000462996	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	29.39	■■■□□ 2.3
PTPN18-208	ENST00000462996	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		29.39	■■■□□ 2.3
PTPN18-208	ENST00000462996	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		29.39	■■■□□ 2.3
PTPN18-208	ENST00000462996	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PTPN18-208	ENST00000462996	BCL9	O00512	1426 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PTPN18-208	ENST00000462996	USP6	P35125	1406 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PTPN18-208	ENST00000462996	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PTPN18-208	ENST00000462996	AKAP12	Q02952	1782 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PTPN18-208	ENST00000462996	TXNRD1	Q16881	649 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PTPN18-208	ENST00000462996	CABP1	Q9NZU7	370 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PTPN18-208	ENST00000462996	SYT17	Q9BSW7	474 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PTPN18-208	ENST00000462996	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
PTPN18-208	ENST00000462996	STK32B	Q9NY57	414 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PTPN18-208	ENST00000462996	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC15A2	Q16348	729 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PTPN18-208	ENST00000462996	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
PTPN18-208	ENST00000462996	PIK3C2A	O00443	1686 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PTPN18-208	ENST00000462996	RGPD5	Q99666	1765 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PTPN18-208	ENST00000462996	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PTPN18-208	ENST00000462996	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PTPN18-208	ENST00000462996	CHD4	Q14839	1912 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PTPN18-208	ENST00000462996	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PTPN18-208	ENST00000462996	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PTPN18-208	ENST00000462996	MTFR1L	Q9H019	292 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PTPN18-208	ENST00000462996	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PTPN18-208	ENST00000462996	EXOC5	O00471	708 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PTPN18-208	ENST00000462996	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PTPN18-208	ENST00000462996	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PTPN18-208	ENST00000462996	SOX12	O15370	315 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PTPN18-208	ENST00000462996	C1QTNF8	P60827	252 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	ARX	Q96QS3	562 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	NHS	Q6T4R5	1651 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	TNS2	Q63HR2	1409 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	CCDC7	Q96M83	1385 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	NFAT5	O94916	1531 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	PAPPA	Q13219	1627 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PTPN18-208	ENST00000462996	MAP3K5	Q99683	1374 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PTPN18-208	ENST00000462996	EVC2	Q86UK5	1308 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF827	Q17R98	1081 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PTPN18-208	ENST00000462996	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PTPN18-208	ENST00000462996	BTAF1	O14981	1849 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PTPN18-208	ENST00000462996	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ABCC6	O95255	1503 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PTPN18-208	ENST00000462996	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PTPN18-208	ENST00000462996	GPR162	Q16538	588 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PTPN18-208	ENST00000462996	CEP350	Q5VT06	3117 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PTPN18-208	ENST00000462996	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PTPN18-208	ENST00000462996	ERBB3	P21860	1342 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PTPN18-208	ENST00000462996	IL2RB	P14784	551 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PTPN18-208	ENST00000462996	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.24
PTPN18-208	ENST00000462996	AKT1S1	Q96B36	256 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PTPN18-208	ENST00000462996	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPN18-208	ENST00000462996	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PTPN18-208	ENST00000462996	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPN18-208	ENST00000462996	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPN18-208	ENST00000462996	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	28.96	■■■□□ 2.23
PTPN18-208	ENST00000462996	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PTPN18-208	ENST00000462996	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PTPN18-208	ENST00000462996	USP31	Q70CQ4	1352 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PTPN18-208	ENST00000462996	LTN1	O94822	1766 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	IFFO2	Q5TF58	517 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	USP54	Q70EL1	1684 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	POLD1	P28340	1107 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	NME9	Q86XW9	330 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	KCNQ4	P56696	695 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPN18-208	ENST00000462996	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPN18-208	ENST00000462996	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PTPN18-208	ENST00000462996	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPN18-208	ENST00000462996	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PTPN18-208	ENST00000462996	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPN18-208	ENST00000462996	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	28.85	■■■□□ 2.21
PTPN18-208	ENST00000462996	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PTPN18-208	ENST00000462996	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PTPN18-208	ENST00000462996	LY75	O60449	1722 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPN18-208	ENST00000462996	NSD2	O96028	1365 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPN18-208	ENST00000462996	IP6K1	Q92551	441 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPN18-208	ENST00000462996	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPN18-208	ENST00000462996	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PTPN18-208	ENST00000462996	GRIN3B	O60391	1043 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PTPN18-208	ENST00000462996	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2

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