RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 TCP11L2Q8N4U5 519 aa33.38■■■□□ 2.93
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SMKR1-201ENST00000462322 CCDC125Q86Z20 511 aa33.36■■■□□ 2.93
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SMKR1-201ENST00000462322 CRB1P82279 1406 aa33.35■■■□□ 2.93
SMKR1-201ENST00000462322 OVOS2Q6IE36 1432 aa33.35■■■□□ 2.93
SMKR1-201ENST00000462322 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
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SMKR1-201ENST00000462322 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.32■■■□□ 2.92
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SMKR1-201ENST00000462322 CARD10Q9BWT7 1032 aa33.22■■■□□ 2.91
SMKR1-201ENST00000462322 NSD3Q9BZ95 1437 aa33.2■■■□□ 2.91
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SMKR1-201ENST00000462322 FAM196AQ6ZSG2 479 aa33.17■■■□□ 2.9
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.17■■■□□ 2.9
SMKR1-201ENST00000462322 IP6K1Q92551 441 aa33.17■■■□□ 2.9
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SMKR1-201ENST00000462322 MAP3K19Q56UN5 1328 aa33.16■■■□□ 2.9
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SMKR1-201ENST00000462322 AMPHP49418 695 aa33.14■■■□□ 2.9
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SMKR1-201ENST00000462322 TRIM37O94972 964 aa33.08■■■□□ 2.89
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SMKR1-201ENST00000462322 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
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SMKR1-201ENST00000462322 KCNQ2O43526 872 aa32.75■■■□□ 2.83
SMKR1-201ENST00000462322 TATP17735 454 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
SMKR1-201ENST00000462322 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
SMKR1-201ENST00000462322 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
SMKR1-201ENST00000462322 PLSCR1O15162 318 aa32.74■■■□□ 2.83
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