RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460130.5

TCL6-204, Transcript of T cell leukemia/lymphoma 6, human

TSL 3 BASIC

Gene TCL6, Length 911 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCL6-204	ENST00000460130	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	16.1	■□□□□ 0.17
TCL6-204	ENST00000460130	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	16.1	■□□□□ 0.17
TCL6-204	ENST00000460130	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	16.09	■□□□□ 0.17
TCL6-204	ENST00000460130	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	16.09	■□□□□ 0.17
TCL6-204	ENST00000460130	APAF1	O14727	1248 aa		16.09	■□□□□ 0.17
TCL6-204	ENST00000460130	IL13	P35225	146 aa		16.09	■□□□□ 0.17
TCL6-204	ENST00000460130	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	16.09	■□□□□ 0.17
TCL6-204	ENST00000460130	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		16.09	■□□□□ 0.17
TCL6-204	ENST00000460130	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	16.09	■□□□□ 0.17
TCL6-204	ENST00000460130	NUDC	Q9Y266	331 aa		16.09	■□□□□ 0.17
TCL6-204	ENST00000460130	RGPD5	Q99666	1765 aa		16.08	■□□□□ 0.17
TCL6-204	ENST00000460130	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	16.08	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	PDE3B	Q13370	1112 aa		16.08	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	RUNDC1	Q96C34	613 aa		16.08	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	16.08	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		16.08	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	AMPH	P49418	695 aa		16.07	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		16.07	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	16.06	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		16.06	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	KIAA0232	Q92628	1395 aa		16.05	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	16.05	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	16.05	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		16.04	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	ADAMTS2	O95450	1211 aa		16.04	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	CHRNA2	Q15822	529 aa		16.04	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		16.04	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	NGEF	Q8N5V2	710 aa		16.04	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		16.04	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		16.04	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	COL18A1	P39060	1754 aa		16.04	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	HOXC9	P31274	260 aa		16.03	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	IP6K1	Q92551	441 aa		16.03	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	CPD	O75976	1380 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	FLT4	P35916	1363 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
TCL6-204	ENST00000460130	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		16.02	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	FAM83G	A6ND36	823 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	SLFN5	Q08AF3	891 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	RTL1	A6NKG5	1358 aa		16	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	FCHSD2	O94868	740 aa		16	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC27	Q2M243	656 aa		16	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		16	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		16	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		16	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	LRP6	O75581	1613 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	WWC1	Q8IX03	1113 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	GOLGA2	Q08379	1002 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	ABCC6	O95255	1503 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	PRKAR2B	P31323	418 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	C8orf37	Q96NL8	207 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	BTG4	Q9NY30	223 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TCL6-204	ENST00000460130	HMOX1	P09601	288 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	EVA1C	P58658	441 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	NGLY1	Q96IV0	654 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		15.94	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	WDR63	Q8IWG1	891 aa		15.94	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	STRN4	Q9NRL3	753 aa		15.94	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	KDR	P35968	1356 aa		15.94	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		15.94	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		15.94	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	NRAP	Q86VF7	1730 aa		15.92	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	FKBP8	Q14318	412 aa		15.92	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	NEUROD2	Q15784	382 aa		15.92	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	EYA1	Q99502	592 aa		15.92	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	ERBB3	P21860	1342 aa		15.92	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130		E9PSI1	815 aa		15.91	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	NFE2L2	Q16236	605 aa		15.91	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		15.91	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	NCAPD2	Q15021	1401 aa		15.91	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	SLIT2	O94813	1529 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	NBPF4	Q96M43	638 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TCL6-204	ENST00000460130	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		15.9	■□□□□ 0.14

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