RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458354.5

PNCK-216, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 3

Gene PNCK, Length 498 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-216	ENST00000458354	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
PNCK-216	ENST00000458354	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		40.47	■■■■■ 4.07
PNCK-216	ENST00000458354	NFAT5	O94916	1531 aa		40.47	■■■■■ 4.07
PNCK-216	ENST00000458354	USP54	Q70EL1	1684 aa		40.47	■■■■■ 4.07
PNCK-216	ENST00000458354	PDE3B	Q13370	1112 aa		40.46	■■■■■ 4.07
PNCK-216	ENST00000458354	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PNCK-216	ENST00000458354	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PNCK-216	ENST00000458354	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		40.44	■■■■■ 4.06
PNCK-216	ENST00000458354	BAG6	P46379	1132 aa		40.42	■■■■■ 4.06
PNCK-216	ENST00000458354	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		40.42	■■■■■ 4.06
PNCK-216	ENST00000458354	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		40.42	■■■■■ 4.06
PNCK-216	ENST00000458354	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		40.42	■■■■■ 4.06
PNCK-216	ENST00000458354	CDCA8	Q53HL2	280 aa		40.41	■■■■■ 4.06
PNCK-216	ENST00000458354	ABCC6	O95255	1503 aa		40.39	■■■■■ 4.06
PNCK-216	ENST00000458354	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		40.39	■■■■■ 4.06
PNCK-216	ENST00000458354	RGPD5	Q99666	1765 aa		40.38	■■■■■ 4.06
PNCK-216	ENST00000458354	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
PNCK-216	ENST00000458354	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		40.35	■■■■■ 4.05
PNCK-216	ENST00000458354	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		40.32	■■■■■ 4.04
PNCK-216	ENST00000458354	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		40.32	■■■■■ 4.04
PNCK-216	ENST00000458354	LTN1	O94822	1766 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PNCK-216	ENST00000458354	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
PNCK-216	ENST00000458354	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		40.29	■■■■■ 4.04
PNCK-216	ENST00000458354	TRIM37	O94972	964 aa		40.28	■■■■■ 4.04
PNCK-216	ENST00000458354	COG3	Q96JB2	828 aa		40.28	■■■■■ 4.04
PNCK-216	ENST00000458354	DDB1	Q16531	1140 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PNCK-216	ENST00000458354	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
PNCK-216	ENST00000458354	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
PNCK-216	ENST00000458354	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		40.25	■■■■■ 4.03
PNCK-216	ENST00000458354	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	40.24	■■■■■ 4.03
PNCK-216	ENST00000458354	LRRC37A3	O60309	1634 aa		40.24	■■■■■ 4.03
PNCK-216	ENST00000458354	CCDC7	Q96M83	1385 aa		40.23	■■■■■ 4.03
PNCK-216	ENST00000458354	DISP2	A7MBM2	1401 aa		40.22	■■■■■ 4.03
PNCK-216	ENST00000458354	ERBB3	P21860	1342 aa		40.19	■■■■■ 4.02
PNCK-216	ENST00000458354	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PNCK-216	ENST00000458354	APBA3	O96018	575 aa		40.17	■■■■■ 4.02
PNCK-216	ENST00000458354	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		40.17	■■■■■ 4.02
PNCK-216	ENST00000458354	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		40.15	■■■■■ 4.02
PNCK-216	ENST00000458354	IP6K1	Q92551	441 aa		40.13	■■■■■ 4.01
PNCK-216	ENST00000458354	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	40.12	■■■■■ 4.01	2e-9	■■■■□ 23.5
PNCK-216	ENST00000458354	EXOC5	O00471	708 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PNCK-216	ENST00000458354	FYB1	O15117	783 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PNCK-216	ENST00000458354	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	40.11	■■■■■ 4.01
PNCK-216	ENST00000458354	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PNCK-216	ENST00000458354	MYOM1	P52179	1685 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PNCK-216	ENST00000458354	PEAK1	Q9H792	1746 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PNCK-216	ENST00000458354	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PNCK-216	ENST00000458354	AMPH	P49418	695 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PNCK-216	ENST00000458354	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PNCK-216	ENST00000458354	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		40.07	■■■■■ 4.01
PNCK-216	ENST00000458354	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		40.07	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	40.05	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		40.05	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	40.04	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	40.03	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	IL2RB	P14784	551 aa		40.03	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	TNS2	Q63HR2	1409 aa		40.02	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	40.02	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	HOXC9	P31274	260 aa		40.02	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		40.01	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	SBF2	Q86WG5	1849 aa		40.01	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	FBLN1	P23142	703 aa		40.01	■■■■■ 4
PNCK-216	ENST00000458354	RTL1	A6NKG5	1358 aa		39.99	■■■■□ 3.99
PNCK-216	ENST00000458354	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	39.99	■■■■□ 3.99
PNCK-216	ENST00000458354	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		39.99	■■■■□ 3.99
PNCK-216	ENST00000458354	BCL9	O00512	1426 aa		39.99	■■■■□ 3.99
PNCK-216	ENST00000458354	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	39.97	■■■■□ 3.99
PNCK-216	ENST00000458354	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	39.97	■■■■□ 3.99
PNCK-216	ENST00000458354	RREB1	Q92766	1687 aa		39.94	■■■■□ 3.98
PNCK-216	ENST00000458354	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	39.92	■■■■□ 3.98
PNCK-216	ENST00000458354	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		39.9	■■■■□ 3.98
PNCK-216	ENST00000458354	NBPF14	Q5TI25	921 aa		39.89	■■■■□ 3.98
PNCK-216	ENST00000458354	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	39.89	■■■■□ 3.98
PNCK-216	ENST00000458354	PLSCR1	O15162	318 aa		39.88	■■■■□ 3.97
PNCK-216	ENST00000458354	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		39.88	■■■■□ 3.97
PNCK-216	ENST00000458354	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	39.87	■■■■□ 3.97
PNCK-216	ENST00000458354	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		39.87	■■■■□ 3.97
PNCK-216	ENST00000458354	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		39.85	■■■■□ 3.97
PNCK-216	ENST00000458354	FLT4	P35916	1363 aa		39.84	■■■■□ 3.97
PNCK-216	ENST00000458354	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		39.83	■■■■□ 3.97
PNCK-216	ENST00000458354	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		39.82	■■■■□ 3.97
PNCK-216	ENST00000458354	INSR	P06213	1382 aa		39.81	■■■■□ 3.96
PNCK-216	ENST00000458354	LRP5	O75197	1615 aa		39.79	■■■■□ 3.96
PNCK-216	ENST00000458354	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		39.78	■■■■□ 3.96
PNCK-216	ENST00000458354	NHS	Q6T4R5	1651 aa		39.78	■■■■□ 3.96
PNCK-216	ENST00000458354	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		39.77	■■■■□ 3.96
PNCK-216	ENST00000458354	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	39.77	■■■■□ 3.96
PNCK-216	ENST00000458354	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		39.77	■■■■□ 3.96
PNCK-216	ENST00000458354	NBPF4	Q96M43	638 aa		39.77	■■■■□ 3.96
PNCK-216	ENST00000458354	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		39.76	■■■■□ 3.96
PNCK-216	ENST00000458354	KCNQ2	O43526	872 aa		39.75	■■■■□ 3.95
PNCK-216	ENST00000458354	PANK3	Q9H999	370 aa		39.75	■■■■□ 3.95
PNCK-216	ENST00000458354	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		39.75	■■■■□ 3.95
PNCK-216	ENST00000458354	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	39.74	■■■■□ 3.95
PNCK-216	ENST00000458354	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		39.71	■■■■□ 3.95
PNCK-216	ENST00000458354	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		39.71	■■■■□ 3.95
PNCK-216	ENST00000458354	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	39.71	■■■■□ 3.95
PNCK-216	ENST00000458354	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		39.71	■■■■□ 3.95
PNCK-216	ENST00000458354	MEGF6	O75095	1541 aa		39.7	■■■■□ 3.95
PNCK-216	ENST00000458354	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	39.68	■■■■□ 3.94

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