RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PIP4K2BP78356 416 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IP6K1Q92551 441 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCA3Q99758 1704 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RUNDC1Q96C34 613 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FCHSD2O94868 740 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCC6O95255 1503 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RGPD5Q99666 1765 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CPDO75976 1380 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NGEFQ8N5V2 710 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COL18A1P39060 1754 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 APAF1O14727 1248 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NEFMP07197 916 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HMOX1P09601 288 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIAA0232Q92628 1395 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRKAR2BP31323 418 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EYA1Q99502 592 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDE3BQ13370 1112 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHRNA2Q15822 529 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FBXO41Q8TF61 875 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KDRP35968 1356 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ERBB3P21860 1342 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC27Q2M243 656 aa19.99■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NBPF6Q5VWK0 638 aa19.99■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NBPF4Q96M43 638 aa19.99■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF521Q96K83 1311 aa19.99■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DLG5Q8TDM6 1919 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NEUROD2Q15784 382 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHACTR3Q96KR7 559 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NCAPD2Q15021 1401 aa19.97■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NFE2L2Q16236 605 aa19.97■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 JCADQ9P266 1359 aa19.96■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa19.96■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RIPK4P57078 832 aa19.96■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WWC1Q8IX03 1113 aa19.96■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM83GA6ND36 823 aa19.95■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GOLGA2Q08379 1002 aa19.95■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USHBP1Q8N6Y0 703 aa19.94■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.94■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LMOD3Q0VAK6 560 aa19.93■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WDR63Q8IWG1 891 aa19.93■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WDR17Q8IZU2 1322 aa19.92■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GAS2L2Q8NHY3 880 aa19.91■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.91■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLCH1Q4KWH8 1693 aa19.91■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EVA1CP58658 441 aa19.9■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.9■□□□□ 0.78
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.88■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa19.88■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 E9PSI1 815 aa19.88■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HSPA1LP34931 641 aa19.88■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLFN5Q08AF3 891 aa19.88■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BTG4Q9NY30 223 aa19.88■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADAMTS2O95450 1211 aa19.87■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa19.87■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 STRN4Q9NRL3 753 aa19.87■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NWD2Q9ULI1 1742 aa19.87■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IL16Q14005 1332 aa19.86■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AMOTQ4VCS5 1084 aa19.86■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.86■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TATP17735 454 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 280.2 ms