RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 USP31Q70CQ4 1352 aa26.4■■□□□ 1.82
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CCDC78-204ENST00000439619 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.39■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.39■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.39■■□□□ 1.81
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CCDC78-204ENST00000439619 DISP2A7MBM2 1401 aa26.37■■□□□ 1.81
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CCDC78-204ENST00000439619 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.34■■□□□ 1.81
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CCDC78-204ENST00000439619 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.31■■□□□ 1.8
CCDC78-204ENST00000439619 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
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CCDC78-204ENST00000439619 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.26■■□□□ 1.79
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CCDC78-204ENST00000439619 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.26■■□□□ 1.79
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CCDC78-204ENST00000439619 USP54Q70EL1 1684 aa26.25■■□□□ 1.79
CCDC78-204ENST00000439619 ERBB3P21860 1342 aa26.24■■□□□ 1.79
CCDC78-204ENST00000439619 NBPF14Q5TI25 921 aa26.22■■□□□ 1.79
CCDC78-204ENST00000439619 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.22■■□□□ 1.79
CCDC78-204ENST00000439619 LRRC37A3O60309 1634 aa26.21■■□□□ 1.79
CCDC78-204ENST00000439619 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
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CCDC78-204ENST00000439619 IP6K1Q92551 441 aa26.19■■□□□ 1.78
CCDC78-204ENST00000439619 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CCDC78-204ENST00000439619 IL2RBP14784 551 aa26.18■■□□□ 1.78
CCDC78-204ENST00000439619 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.18■■□□□ 1.78
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CCDC78-204ENST00000439619 BCL9O00512 1426 aa26.16■■□□□ 1.78
CCDC78-204ENST00000439619 RGPD5Q99666 1765 aa26.15■■□□□ 1.78
CCDC78-204ENST00000439619 TNS2Q63HR2 1409 aa26.14■■□□□ 1.78
CCDC78-204ENST00000439619 PLSCR1O15162 318 aa26.14■■□□□ 1.78
CCDC78-204ENST00000439619 LTN1O94822 1766 aa26.13■■□□□ 1.77
CCDC78-204ENST00000439619 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
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CCDC78-204ENST00000439619 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.11■■□□□ 1.77
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CCDC78-204ENST00000439619 RTL1A6NKG5 1358 aa26.08■■□□□ 1.77
CCDC78-204ENST00000439619 LRP5O75197 1615 aa26.08■■□□□ 1.77
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CCDC78-204ENST00000439619 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.02■■□□□ 1.76
CCDC78-204ENST00000439619 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
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CCDC78-204ENST00000439619 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.01■■□□□ 1.75
CCDC78-204ENST00000439619 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.01■■□□□ 1.75
CCDC78-204ENST00000439619 KIF24Q5T7B8 1368 aa26■■□□□ 1.75
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CCDC78-204ENST00000439619 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC78-204ENST00000439619 KCNQ2O43526 872 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC78-204ENST00000439619 TXNRD1Q16881 649 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC78-204ENST00000439619 SBF2Q86WG5 1849 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC78-204ENST00000439619 FLT4P35916 1363 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC78-204ENST00000439619 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CCDC78-204ENST00000439619 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.96■■□□□ 1.75
CCDC78-204ENST00000439619 STK32BQ9NY57 414 aa25.96■■□□□ 1.75
CCDC78-204ENST00000439619 INSRP06213 1382 aa25.95■■□□□ 1.75
CCDC78-204ENST00000439619 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 PROM2Q8N271 834 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 SPON1Q9HCB6 807 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.94■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 NBPF4Q96M43 638 aa25.94■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.93■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.93■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 MYOM1P52179 1685 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 NHSQ6T4R5 1651 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CCDC78-204ENST00000439619 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
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