RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 DDB1Q16531 1140 aa17.57■□□□□ 0.4
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PRAME-208ENST00000438888 YY1P25490 414 aa17.35■□□□□ 0.37
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PRAME-208ENST00000438888 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 LRRC4BQ9NT99 713 aa17.25■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 GGNBP2Q9H3C7 697 aa17.24■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 KAT6BQ8WYB5 2073 aa17.24■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 MEGF6O75095 1541 aa17.23■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 KCNQ4P56696 695 aa17.23■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 TMF1P82094 1093 aa17.23■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 USHBP1Q8N6Y0 703 aa17.23■□□□□ 0.35
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