RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436228.6

SPDYE2B-201, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-201ENST00000436228 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.85■■□□□ 1.25
SPDYE2B-201ENST00000436228 USP54Q70EL1 1684 aa22.84■■□□□ 1.25
SPDYE2B-201ENST00000436228 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SPDYE2B-201ENST00000436228 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.84■■□□□ 1.25
SPDYE2B-201ENST00000436228 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.82■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.82■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.82■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.82■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.82■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.81■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.81■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 NSD2O96028 1365 aa22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 BARGINQ6ZT62 677 aa22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 NFAT5O94916 1531 aa22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2B-201ENST00000436228 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 USP35Q9P2H5 1018 aa22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 CRB1P82279 1406 aa22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 ABCC6O95255 1503 aa22.74■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 MORC1Q86VD1 984 aa22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.73■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 AMPHP49418 695 aa22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.72■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 LTN1O94822 1766 aa22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 COL18A1P39060 1754 aa22.71■■□□□ 1.23
SPDYE2B-201ENST00000436228 PDE3BQ13370 1112 aa22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.7■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.69■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.68■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 FBLN1P23142 703 aa22.67■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.67■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.66■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 IP6K1Q92551 441 aa22.66■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.66■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 RTL1A6NKG5 1358 aa22.65■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 BAG6P46379 1132 aa22.65■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 RGPD5Q99666 1765 aa22.64■■□□□ 1.22
SPDYE2B-201ENST00000436228 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.63■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.63■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 HOXC9P31274 260 aa22.63■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.63■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 FLT4P35916 1363 aa22.62■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.61■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.61■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 DDB1Q16531 1140 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 ERBB3P21860 1342 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 FAM182BQ5T319 152 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 POLKQ9UBT6 870 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.58■■□□□ 1.21
SPDYE2B-201ENST00000436228 EP400Q96L91 3159 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 INSRP06213 1382 aa22.56■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.55■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.55■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 PEAK1Q9H792 1746 aa22.54■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 LRRC37A3O60309 1634 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 EXOC5O00471 708 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 TRIM37O94972 964 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 DISP2A7MBM2 1401 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-201ENST00000436228 MTHFSP49914 203 aa22.51■■□□□ 1.19
SPDYE2B-201ENST00000436228 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2B-201ENST00000436228 IL2RBP14784 551 aa22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2B-201ENST00000436228 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SPDYE2B-201ENST00000436228 APBA3O96018 575 aa22.49■■□□□ 1.19
SPDYE2B-201ENST00000436228 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SPDYE2B-201ENST00000436228 RALBP1Q15311 655 aa22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2B-201ENST00000436228 BCL9O00512 1426 aa22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2B-201ENST00000436228 TNS2Q63HR2 1409 aa22.47■■□□□ 1.19
SPDYE2B-201ENST00000436228 CFAP53Q96M91 514 aa22.46■■□□□ 1.19
SPDYE2B-201ENST00000436228 PPP2R1AP30153 589 aa22.45■■□□□ 1.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.44■■□□□ 1.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 NBPF4Q96M43 638 aa22.44■■□□□ 1.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.43■■□□□ 1.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.42■■□□□ 1.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.42■■□□□ 1.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms