RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 DDB1Q16531 1140 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 USP31Q70CQ4 1352 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-206ENST00000431413 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.33■■□□□ 1
HERC3-206ENST00000431413 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.32■■□□□ 1
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HERC3-206ENST00000431413 NME9Q86XW9 330 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-206ENST00000431413 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-206ENST00000431413 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HERC3-206ENST00000431413 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HERC3-206ENST00000431413 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.32■■□□□ 1
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HERC3-206ENST00000431413 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-206ENST00000431413 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-206ENST00000431413 COL18A1P39060 1754 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-206ENST00000431413 TESK2Q96S53 571 aa21.31■■□□□ 1
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HERC3-206ENST00000431413 A0A1W2PP64 1363 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-206ENST00000431413 CCDC7Q96M83 1385 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-206ENST00000431413 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
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HERC3-206ENST00000431413 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-206ENST00000431413 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.24■□□□□ 0.99
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HERC3-206ENST00000431413 USP47Q96K76 1375 aa21.23■□□□□ 0.99
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HERC3-206ENST00000431413 CDCA8Q53HL2 280 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-206ENST00000431413 COG3Q96JB2 828 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-206ENST00000431413 USP54Q70EL1 1684 aa21.23■□□□□ 0.99
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HERC3-206ENST00000431413 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
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HERC3-206ENST00000431413 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-206ENST00000431413 PEAK1Q9H792 1746 aa21.18■□□□□ 0.98
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HERC3-206ENST00000431413 IP6K1Q92551 441 aa21.18■□□□□ 0.98
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HERC3-206ENST00000431413 TNS2Q63HR2 1409 aa21.16■□□□□ 0.98
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HERC3-206ENST00000431413 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.1■□□□□ 0.97
HERC3-206ENST00000431413 FYB1O15117 783 aa21.1■□□□□ 0.97
HERC3-206ENST00000431413 HOXC9P31274 260 aa21.1■□□□□ 0.97
HERC3-206ENST00000431413 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.09■□□□□ 0.97
HERC3-206ENST00000431413 RTL1A6NKG5 1358 aa21.08■□□□□ 0.96
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HERC3-206ENST00000431413 KCNQ2O43526 872 aa21.06■□□□□ 0.96
HERC3-206ENST00000431413 FBLN1P23142 703 aa21.06■□□□□ 0.96
HERC3-206ENST00000431413 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.06■□□□□ 0.96
HERC3-206ENST00000431413 PROM2Q8N271 834 aa21.05■□□□□ 0.96
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HERC3-206ENST00000431413 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
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HERC3-206ENST00000431413 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
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HERC3-206ENST00000431413 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-206ENST00000431413 NBPF4Q96M43 638 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-206ENST00000431413 INSRP06213 1382 aa20.97■□□□□ 0.95
HERC3-206ENST00000431413 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.97■□□□□ 0.95
HERC3-206ENST00000431413 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.96■□□□□ 0.95
HERC3-206ENST00000431413 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HERC3-206ENST00000431413 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
HERC3-206ENST00000431413 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.94■□□□□ 0.94
HERC3-206ENST00000431413 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.93■□□□□ 0.94
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