RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.79■■■□□ 2.36
LIMS1-208ENST00000428064 USP31Q70CQ4 1352 aa29.78■■■□□ 2.36
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.78■■■□□ 2.36
LIMS1-208ENST00000428064 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
LIMS1-208ENST00000428064 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.77■■■□□ 2.36
LIMS1-208ENST00000428064 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.77■■■□□ 2.36
LIMS1-208ENST00000428064 RGPD5Q99666 1765 aa29.77■■■□□ 2.36
LIMS1-208ENST00000428064 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.75■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.75■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.75■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.75■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 APBA3O96018 575 aa29.72■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.71■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.71■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.7■■■□□ 2.35
LIMS1-208ENST00000428064 SBF2Q86WG5 1849 aa29.7■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 SLC24A1O60721 1099 aa29.69■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 DDB1Q16531 1140 aa29.69■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.69■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 BCL9O00512 1426 aa29.69■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PP64 1363 aa29.68■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 LTN1O94822 1766 aa29.67■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 SOX12O15370 315 aa29.67■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.67■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 TMC1Q8TDI8 760 aa29.67■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 TESK2Q96S53 571 aa29.67■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.67■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC7Q96M83 1385 aa29.66■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.66■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 NME9Q86XW9 330 aa29.65■■■□□ 2.34
LIMS1-208ENST00000428064 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.62■■■□□ 2.33
LIMS1-208ENST00000428064 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.62■■■□□ 2.33
LIMS1-208ENST00000428064 ERBB3P21860 1342 aa29.61■■■□□ 2.33
LIMS1-208ENST00000428064 TNS2Q63HR2 1409 aa29.59■■■□□ 2.33
LIMS1-208ENST00000428064 PLSCR1O15162 318 aa29.57■■■□□ 2.32
LIMS1-208ENST00000428064 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
LIMS1-208ENST00000428064 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
LIMS1-208ENST00000428064 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
LIMS1-208ENST00000428064 NBPF14Q5TI25 921 aa29.54■■■□□ 2.32
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.52■■■□□ 2.32
LIMS1-208ENST00000428064 USP47Q96K76 1375 aa29.52■■■□□ 2.32
LIMS1-208ENST00000428064 EXOC5O00471 708 aa29.52■■■□□ 2.32
LIMS1-208ENST00000428064 NHSQ6T4R5 1651 aa29.49■■■□□ 2.31
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.48■■■□□ 2.31
LIMS1-208ENST00000428064 TMF1P82094 1093 aa29.47■■■□□ 2.31
LIMS1-208ENST00000428064 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.47■■■□□ 2.31
LIMS1-208ENST00000428064 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.47■■■□□ 2.31
LIMS1-208ENST00000428064 IP6K1Q92551 441 aa29.46■■■□□ 2.31
LIMS1-208ENST00000428064 IL2RBP14784 551 aa29.45■■■□□ 2.31
LIMS1-208ENST00000428064 COG3Q96JB2 828 aa29.45■■■□□ 2.31
LIMS1-208ENST00000428064 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.45■■■□□ 2.3
LIMS1-208ENST00000428064 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.44■■■□□ 2.3
LIMS1-208ENST00000428064 CDCA8Q53HL2 280 aa29.4■■■□□ 2.3
LIMS1-208ENST00000428064 RTL1A6NKG5 1358 aa29.39■■■□□ 2.3
LIMS1-208ENST00000428064 CASZ1Q86V15 1759 aa29.39■■■□□ 2.3
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.39■■■□□ 2.3
LIMS1-208ENST00000428064 PROM2Q8N271 834 aa29.38■■■□□ 2.29
LIMS1-208ENST00000428064 MYOM1P52179 1685 aa29.37■■■□□ 2.29
LIMS1-208ENST00000428064 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.37■■■□□ 2.29
LIMS1-208ENST00000428064 HOXC9P31274 260 aa29.36■■■□□ 2.29
LIMS1-208ENST00000428064 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
LIMS1-208ENST00000428064 FYB1O15117 783 aa29.34■■■□□ 2.29
LIMS1-208ENST00000428064 KCNQ2O43526 872 aa29.33■■■□□ 2.29
LIMS1-208ENST00000428064 TXNRD1Q16881 649 aa29.33■■■□□ 2.29
LIMS1-208ENST00000428064 SPON1Q9HCB6 807 aa29.33■■■□□ 2.29
LIMS1-208ENST00000428064 BTAF1O14981 1849 aa29.33■■■□□ 2.29
LIMS1-208ENST00000428064 AMPHP49418 695 aa29.31■■■□□ 2.28
LIMS1-208ENST00000428064 PAPPAQ13219 1627 aa29.31■■■□□ 2.28
LIMS1-208ENST00000428064 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.3■■■□□ 2.28
LIMS1-208ENST00000428064 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.28■■■□□ 2.28
LIMS1-208ENST00000428064 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.28■■■□□ 2.28
LIMS1-208ENST00000428064 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
LIMS1-208ENST00000428064 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.28■■■□□ 2.28
LIMS1-208ENST00000428064 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.28■■■□□ 2.28
LIMS1-208ENST00000428064 FBLN1P23142 703 aa29.27■■■□□ 2.28
LIMS1-208ENST00000428064 STK32BQ9NY57 414 aa29.25■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 SLC15A2Q16348 729 aa29.24■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 MEGF6O75095 1541 aa29.24■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 INSRP06213 1382 aa29.22■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.22■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.21■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.21■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 FLT4P35916 1363 aa29.21■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.2■■■□□ 2.27
LIMS1-208ENST00000428064 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
LIMS1-208ENST00000428064 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.2■■■□□ 2.26
LIMS1-208ENST00000428064 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.19■■■□□ 2.26
LIMS1-208ENST00000428064 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.18■■■□□ 2.26
LIMS1-208ENST00000428064 NBPF4Q96M43 638 aa29.18■■■□□ 2.26
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