RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 ABCC6O95255 1503 aa21.77■■□□□ 1.08
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SPC24-201ENST00000423327 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.77■■□□□ 1.08
SPC24-201ENST00000423327 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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SPC24-201ENST00000423327 RTL1A6NKG5 1358 aa21.52■■□□□ 1.04
SPC24-201ENST00000423327 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SPC24-201ENST00000423327 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.51■■□□□ 1.03
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SPC24-201ENST00000423327 APBA3O96018 575 aa21.5■■□□□ 1.03
SPC24-201ENST00000423327 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SPC24-201ENST00000423327 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.49■■□□□ 1.03
SPC24-201ENST00000423327 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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SPC24-201ENST00000423327 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.48■■□□□ 1.03
SPC24-201ENST00000423327 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.48■■□□□ 1.03
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SPC24-201ENST00000423327 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.47■■□□□ 1.03
SPC24-201ENST00000423327 EXOC5O00471 708 aa21.46■■□□□ 1.03
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SPC24-201ENST00000423327 FLT4P35916 1363 aa21.43■■□□□ 1.02
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SPC24-201ENST00000423327 KCNQ2O43526 872 aa21.39■■□□□ 1.01
SPC24-201ENST00000423327 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SPC24-201ENST00000423327 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.39■■□□□ 1.01
SPC24-201ENST00000423327 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.38■■□□□ 1.01
SPC24-201ENST00000423327 PLSCR1O15162 318 aa21.38■■□□□ 1.01
SPC24-201ENST00000423327 BTAF1O14981 1849 aa21.38■■□□□ 1.01
SPC24-201ENST00000423327 NCAPD2Q15021 1401 aa21.38■■□□□ 1.01
SPC24-201ENST00000423327 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SPC24-201ENST00000423327 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.37■■□□□ 1.01
SPC24-201ENST00000423327 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.36■■□□□ 1.01
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