RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421202.5

CCDC18-AS1-205, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC18-AS1, Length 2,973 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PSMD1Q99460 953 aa8.4□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.39□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.39□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.39□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.39□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TBX22Q9Y458 520 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KCNA6P17658 529 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IDI1Q13907 227 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ALKQ9UM73 1620 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DCCP43146 1447 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GLMNQ92990 594 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NUP155O75694 1391 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TOM1O60784 492 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HIC1Q14526 733 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KIF1BO60333 1816 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NEUROD1Q13562 356 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 STAC3Q96MF2 364 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LTKP29376 864 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PTGDRQ13258 359 aa8.34□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KIF12Q96FN5 646 aa8.34□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.34□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LAMC1P11047 1609 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CLTCL1P53675 1640 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ITGAEP38570 1179 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ABL2P42684 1182 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 WWC1Q8IX03 1113 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IFT172Q9UG01 1749 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RFC5P40937 340 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PTCH1Q13635 1447 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PPLO60437 1756 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CDCA8Q53HL2 280 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FCHSD2O94868 740 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AKT1S1Q96B36 256 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SIRT1Q96EB6 747 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8.29□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.29□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CCDC27Q2M243 656 aa8.29□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MYOM2P54296 1465 aa8.29□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.29□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.29□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TECPR2O15040 1411 aa8.29□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.29□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.28□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.28□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TBC1D12O60347 775 aa8.28□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PLPP6Q8IY26 295 aa8.28□□□□□ -1.08
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.27□□□□□ -1.09
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MSH6P52701 1360 aa8.26□□□□□ -1.09
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.26□□□□□ -1.09
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.25□□□□□ -1.09
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.25□□□□□ -1.09
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.25□□□□□ -1.09
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM94Q12767 1356 aa8.25□□□□□ -1.09
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SHPRHQ149N8 1683 aa8.25□□□□□ -1.09
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MAP3K9P80192 1104 aa8.25□□□□□ -1.09
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PHF12Q96QT6 1004 aa8.25□□□□□ -1.09
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