RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 MAP3K5Q99683 1374 aa28.43■■■□□ 2.14
GTPBP1-202ENST00000418601 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.43■■■□□ 2.14
GTPBP1-202ENST00000418601 ARXQ96QS3 562 aa28.43■■■□□ 2.14
GTPBP1-202ENST00000418601 GCP02774 474 aa28.42■■■□□ 2.14
GTPBP1-202ENST00000418601 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.42■■■□□ 2.14
GTPBP1-202ENST00000418601 BCL9O00512 1426 aa28.42■■■□□ 2.14
GTPBP1-202ENST00000418601 GPR162Q16538 588 aa28.4■■■□□ 2.14
GTPBP1-202ENST00000418601 NLRP13Q86W25 1043 aa28.39■■■□□ 2.14
GTPBP1-202ENST00000418601 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
GTPBP1-202ENST00000418601 CEP350Q5VT06 3117 aa28.38■■■□□ 2.13
GTPBP1-202ENST00000418601 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.38■■■□□ 2.13
GTPBP1-202ENST00000418601 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.38■■■□□ 2.13
GTPBP1-202ENST00000418601 CDK19Q9BWU1 502 aa28.38■■■□□ 2.13
GTPBP1-202ENST00000418601 PAPPAQ13219 1627 aa28.38■■■□□ 2.13
GTPBP1-202ENST00000418601 NHSQ6T4R5 1651 aa28.35■■■□□ 2.13
GTPBP1-202ENST00000418601 SLIT3O75094 1523 aa28.34■■■□□ 2.13
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.34■■■□□ 2.13
GTPBP1-202ENST00000418601 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.33■■■□□ 2.13
GTPBP1-202ENST00000418601 COL18A1P39060 1754 aa28.32■■■□□ 2.12
GTPBP1-202ENST00000418601 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.32■■■□□ 2.12
GTPBP1-202ENST00000418601 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
GTPBP1-202ENST00000418601 KLHL34Q8N239 644 aa28.31■■■□□ 2.12
GTPBP1-202ENST00000418601 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.3■■■□□ 2.12
GTPBP1-202ENST00000418601 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
GTPBP1-202ENST00000418601 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.27■■■□□ 2.12
GTPBP1-202ENST00000418601 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.27■■■□□ 2.12
GTPBP1-202ENST00000418601 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
GTPBP1-202ENST00000418601 TNS2Q63HR2 1409 aa28.25■■■□□ 2.11
GTPBP1-202ENST00000418601 RGPD5Q99666 1765 aa28.24■■■□□ 2.11
GTPBP1-202ENST00000418601 PIK3C2AO00443 1686 aa28.23■■■□□ 2.11
GTPBP1-202ENST00000418601 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
GTPBP1-202ENST00000418601 NLRP6P59044 892 aa28.22■■■□□ 2.11
GTPBP1-202ENST00000418601 BTAF1O14981 1849 aa28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF827Q17R98 1081 aa28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-202ENST00000418601 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-202ENST00000418601 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-202ENST00000418601 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
GTPBP1-202ENST00000418601 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.2■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.2■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.19■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 USP6P35125 1406 aa28.19■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCC6O95255 1503 aa28.19■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 EXOC5O00471 708 aa28.19■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.18■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.18■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 POLD1P28340 1107 aa28.17■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.17■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 ATP10DQ9P241 1426 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC7Q96M83 1385 aa28.13■■■□□ 2.09
GTPBP1-202ENST00000418601 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.13■■■□□ 2.09
GTPBP1-202ENST00000418601 STAC3Q96MF2 364 aa28.12■■■□□ 2.09
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.11■■■□□ 2.09
GTPBP1-202ENST00000418601 HSPA6P17066 643 aa28.1■■■□□ 2.09
GTPBP1-202ENST00000418601 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.091e-9■□□□□ 9.9
GTPBP1-202ENST00000418601 CABP2Q9NPB3 220 aa28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-202ENST00000418601 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-202ENST00000418601 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-202ENST00000418601 SOX12O15370 315 aa28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-202ENST00000418601 GRIN3BO60391 1043 aa28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-202ENST00000418601 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.07■■■□□ 2.08
GTPBP1-202ENST00000418601 AKT1S1Q96B36 256 aa28.06■■■□□ 2.08
GTPBP1-202ENST00000418601 NFAT5O94916 1531 aa28.05■■■□□ 2.08
GTPBP1-202ENST00000418601 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
GTPBP1-202ENST00000418601 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.03■■■□□ 2.08
GTPBP1-202ENST00000418601 CABP1Q9NZU7 370 aa28.03■■■□□ 2.08
GTPBP1-202ENST00000418601 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
GTPBP1-202ENST00000418601 ADCY9O60503 1353 aa27.99■■■□□ 2.07
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.98■■■□□ 2.07
GTPBP1-202ENST00000418601 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.98■■■□□ 2.07
GTPBP1-202ENST00000418601 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.97■■■□□ 2.07
GTPBP1-202ENST00000418601 IL2RBP14784 551 aa27.94■■■□□ 2.06
GTPBP1-202ENST00000418601 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.93■■■□□ 2.06
GTPBP1-202ENST00000418601 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.93■■■□□ 2.06
GTPBP1-202ENST00000418601 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.93■■■□□ 2.06
GTPBP1-202ENST00000418601 ERBB3P21860 1342 aa27.92■■■□□ 2.06
GTPBP1-202ENST00000418601 KCNQ4P56696 695 aa27.91■■■□□ 2.06
GTPBP1-202ENST00000418601 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.91■■■□□ 2.06
GTPBP1-202ENST00000418601 LY75O60449 1722 aa27.91■■■□□ 2.06
GTPBP1-202ENST00000418601 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.91■■■□□ 2.06
GTPBP1-202ENST00000418601 LTN1O94822 1766 aa27.9■■■□□ 2.06
GTPBP1-202ENST00000418601 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.89■■■□□ 2.05
GTPBP1-202ENST00000418601 MSH5O43196 834 aa27.88■■■□□ 2.05
GTPBP1-202ENST00000418601 MSL1Q68DK7 614 aa27.85■■■□□ 2.05
GTPBP1-202ENST00000418601 USP54Q70EL1 1684 aa27.83■■■□□ 2.05
GTPBP1-202ENST00000418601 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.82■■■□□ 2.04
GTPBP1-202ENST00000418601 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
GTPBP1-202ENST00000418601 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
GTPBP1-202ENST00000418601 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.8■■■□□ 2.04
GTPBP1-202ENST00000418601 EVC2Q86UK5 1308 aa27.8■■■□□ 2.04
GTPBP1-202ENST00000418601 NSD2O96028 1365 aa27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-202ENST00000418601 KIF3CO14782 793 aa27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-202ENST00000418601 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-202ENST00000418601 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
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