RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
UBXN4-202ENST00000415164 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.61■■■□□ 2.01
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC37A3O60309 1634 aa27.59■■■□□ 2.01
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.58■■■□□ 2.01
UBXN4-202ENST00000415164 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
UBXN4-202ENST00000415164 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.56■■■□□ 2
UBXN4-202ENST00000415164 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.56■■■□□ 2
UBXN4-202ENST00000415164 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.55■■■□□ 2
UBXN4-202ENST00000415164 SPON1Q9HCB6 807 aa27.55■■■□□ 2
UBXN4-202ENST00000415164 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
UBXN4-202ENST00000415164 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
UBXN4-202ENST00000415164 COL18A1P39060 1754 aa27.53■■■□□ 2
UBXN4-202ENST00000415164 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
UBXN4-202ENST00000415164 PEAK1Q9H792 1746 aa27.53■■■□□ 2
UBXN4-202ENST00000415164 KCNQ2O43526 872 aa27.52■■■□□ 2
UBXN4-202ENST00000415164 TMC1Q8TDI8 760 aa27.52■■■□□ 2
UBXN4-202ENST00000415164 PLSCR1O15162 318 aa27.51■■□□□ 1.99
UBXN4-202ENST00000415164 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.51■■□□□ 1.99
UBXN4-202ENST00000415164 EXOC5O00471 708 aa27.5■■□□□ 1.99
UBXN4-202ENST00000415164 AKAP12Q02952 1782 aa27.5■■□□□ 1.99
UBXN4-202ENST00000415164 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.49■■□□□ 1.99
UBXN4-202ENST00000415164 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
UBXN4-202ENST00000415164 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.46■■□□□ 1.99
UBXN4-202ENST00000415164 RGPD5Q99666 1765 aa27.46■■□□□ 1.99
UBXN4-202ENST00000415164 NME9Q86XW9 330 aa27.46■■□□□ 1.99
UBXN4-202ENST00000415164 NFAT5O94916 1531 aa27.46■■□□□ 1.99
UBXN4-202ENST00000415164 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.45■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.45■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC7Q96M83 1385 aa27.45■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 SBF2Q86WG5 1849 aa27.44■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB7AO95365 584 aa27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 YY1P25490 414 aa27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 STK32BQ9NY57 414 aa27.42■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 PROM2Q8N271 834 aa27.41■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.4■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 TXNRD1Q16881 649 aa27.4■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.39■■□□□ 1.98
UBXN4-202ENST00000415164 TNS2Q63HR2 1409 aa27.39■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.38■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 TONSLQ96HA7 1378 aa27.38■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 BCL9O00512 1426 aa27.38■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 USP31Q70CQ4 1352 aa27.37■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.37■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.37■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 ERBB3P21860 1342 aa27.37■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.36■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 IL2RBP14784 551 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 ABCC6O95255 1503 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.34■■□□□ 1.97
UBXN4-202ENST00000415164 SLC15A2Q16348 729 aa27.33■■□□□ 1.97
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UBXN4-202ENST00000415164 A0A1W2PP64 1363 aa27.31■■□□□ 1.96
UBXN4-202ENST00000415164 CASZ1Q86V15 1759 aa27.3■■□□□ 1.96
UBXN4-202ENST00000415164 LTN1O94822 1766 aa27.29■■□□□ 1.96
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UBXN4-202ENST00000415164 PTGER2P43116 358 aa27.25■■□□□ 1.95
UBXN4-202ENST00000415164 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
UBXN4-202ENST00000415164 USP54Q70EL1 1684 aa27.24■■□□□ 1.95
UBXN4-202ENST00000415164 MYOM1P52179 1685 aa27.24■■□□□ 1.95
UBXN4-202ENST00000415164 COG3Q96JB2 828 aa27.23■■□□□ 1.95
UBXN4-202ENST00000415164 IP6K1Q92551 441 aa27.22■■□□□ 1.95
UBXN4-202ENST00000415164 MTFR1LQ9H019 292 aa27.22■■□□□ 1.95
UBXN4-202ENST00000415164 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.21■■□□□ 1.95
UBXN4-202ENST00000415164 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
UBXN4-202ENST00000415164 AMPHP49418 695 aa27.2■■□□□ 1.94
UBXN4-202ENST00000415164 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
UBXN4-202ENST00000415164 FBLN1P23142 703 aa27.18■■□□□ 1.94
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UBXN4-202ENST00000415164 ZNF827Q17R98 1081 aa27.17■■□□□ 1.94
UBXN4-202ENST00000415164 SYT17Q9BSW7 474 aa27.16■■□□□ 1.94
UBXN4-202ENST00000415164 BTAF1O14981 1849 aa27.16■■□□□ 1.94
UBXN4-202ENST00000415164 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.16■■□□□ 1.94
UBXN4-202ENST00000415164 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.15■■□□□ 1.94
UBXN4-202ENST00000415164 TESK2Q96S53 571 aa27.15■■□□□ 1.94
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.15■■□□□ 1.94
UBXN4-202ENST00000415164 HOXC9P31274 260 aa27.14■■□□□ 1.94
UBXN4-202ENST00000415164 KLHL34Q8N239 644 aa27.14■■□□□ 1.94
UBXN4-202ENST00000415164 ARXQ96QS3 562 aa27.13■■□□□ 1.93
UBXN4-202ENST00000415164 KCNQ4P56696 695 aa27.11■■□□□ 1.93
UBXN4-202ENST00000415164 PAPPAQ13219 1627 aa27.1■■□□□ 1.93
UBXN4-202ENST00000415164 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
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UBXN4-202ENST00000415164 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
UBXN4-202ENST00000415164 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.09■■□□□ 1.93
UBXN4-202ENST00000415164 SLC24A1O60721 1099 aa27.08■■□□□ 1.93
UBXN4-202ENST00000415164 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.08■■□□□ 1.93
UBXN4-202ENST00000415164 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
UBXN4-202ENST00000415164 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.07■■□□□ 1.92
UBXN4-202ENST00000415164 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.07■■□□□ 1.92
UBXN4-202ENST00000415164 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.07■■□□□ 1.92
UBXN4-202ENST00000415164 TMF1P82094 1093 aa27.06■■□□□ 1.92
UBXN4-202ENST00000415164 AKT1S1Q96B36 256 aa27.06■■□□□ 1.92
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