RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 ADGRB1O14514 1584 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRC-206ENST00000413409 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRC-206ENST00000413409 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRC-206ENST00000413409 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRC-206ENST00000413409 SBF2Q86WG5 1849 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRC-206ENST00000413409 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRC-206ENST00000413409 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRC-206ENST00000413409 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRC-206ENST00000413409 CPDO75976 1380 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 ATP7BP35670 1465 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 STAC3Q96MF2 364 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 SLC15A2Q16348 729 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 MTFR1LQ9H019 292 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 USP19O94966 1318 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 STK32BQ9NY57 414 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRC-206ENST00000413409 TXNRD1Q16881 649 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 CRB1P82279 1406 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 LRRC37A3O60309 1634 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 ACEP12821 1306 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 DDB1Q16531 1140 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 ABTB2Q8N961 1025 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 ARXQ96QS3 562 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 GCP02774 474 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 ITSN1Q15811 1721 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 MAP3K5Q99683 1374 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRC-206ENST00000413409 CDK19Q9BWU1 502 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 BCL9O00512 1426 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 GPR162Q16538 588 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 NLRP13Q86W25 1043 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRC-206ENST00000413409 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRC-206ENST00000413409 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRC-206ENST00000413409 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRC-206ENST00000413409 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRC-206ENST00000413409 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRC-206ENST00000413409 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRC-206ENST00000413409 AKAP12Q02952 1782 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF827Q17R98 1081 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRC-206ENST00000413409 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRC-206ENST00000413409 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRC-206ENST00000413409 COL18A1P39060 1754 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 PAPPAQ13219 1627 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 KLHL34Q8N239 644 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 NLRP6P59044 892 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 TESK2Q96S53 571 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 SLIT3O75094 1523 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 EXOC5O00471 708 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRC-206ENST00000413409 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 NHSQ6T4R5 1651 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 AKT1S1Q96B36 256 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 ATP10DQ9P241 1426 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 HSPA6P17066 643 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 TMF1P82094 1093 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 RGPD5Q99666 1765 aa23.2■■□□□ 1.31
PTPRC-206ENST00000413409 POLD1P28340 1107 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 CABP2Q9NPB3 220 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 USP6P35125 1406 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 TNS2Q63HR2 1409 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 GRIN3BO60391 1043 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 CABP1Q9NZU7 370 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 BTAF1O14981 1849 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 PIK3C2AO00443 1686 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 SLC24A1O60721 1099 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 MRS2Q9HD23 443 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 CDCA8Q53HL2 280 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
PTPRC-206ENST00000413409 SOX12O15370 315 aa23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms