RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.66■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.66■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 NEUROD2Q15784 382 aa26.65■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.65■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.65■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.64■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.64■■□□□ 1.86
ODC1-202ENST00000405333 PRKAR2BP31323 418 aa26.63■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 ARHGEF10O15013 1369 aa26.63■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.62■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 FCHSD2O94868 740 aa26.62■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 ZNF521Q96K83 1311 aa26.61■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 IP6K1Q92551 441 aa26.61■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 RTL1A6NKG5 1358 aa26.61■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.6■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.6■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 RGPD5Q99666 1765 aa26.59■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 EYA1Q99502 592 aa26.58■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.58■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.58■■□□□ 1.85
ODC1-202ENST00000405333 PIP4K2BP78356 416 aa26.57■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 WWC1Q8IX03 1113 aa26.55■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.55■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 ABCA3Q99758 1704 aa26.54■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.53■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 TOM1O60784 492 aa26.53■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 CHRNA2Q15822 529 aa26.53■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.52■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 KIAA0232Q92628 1395 aa26.52■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 COL18A1P39060 1754 aa26.51■■□□□ 1.84
ODC1-202ENST00000405333 PDE3BQ13370 1112 aa26.51■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.51■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 GOLGA2Q08379 1002 aa26.49■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.49■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 NBPF4Q96M43 638 aa26.49■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.49■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 KDRP35968 1356 aa26.49■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 RIPK4P57078 832 aa26.49■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 PHLPP1O60346 1717 aa26.48■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 NGEFQ8N5V2 710 aa26.48■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.48■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.48■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 NEFMP07197 916 aa26.46■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 CCDC27Q2M243 656 aa26.46■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.46■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 NFE2L2Q16236 605 aa26.45■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 CPDO75976 1380 aa26.45■■□□□ 1.83
ODC1-202ENST00000405333 SLFN5Q08AF3 891 aa26.45■■□□□ 1.82
ODC1-202ENST00000405333 CERKQ8TCT0 537 aa26.45■■□□□ 1.82
ODC1-202ENST00000405333 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ODC1-202ENST00000405333 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.43■■□□□ 1.82
ODC1-202ENST00000405333 ERBB3P21860 1342 aa26.43■■□□□ 1.82
ODC1-202ENST00000405333 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.41■■□□□ 1.82
ODC1-202ENST00000405333 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
ODC1-202ENST00000405333 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
ODC1-202ENST00000405333 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
ODC1-202ENST00000405333 FAM83GA6ND36 823 aa26.39■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 WDR63Q8IWG1 891 aa26.39■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.38■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.38■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 E9PSI1 815 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 ABCC6O95255 1503 aa26.36■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 DCTN1Q14203 1278 aa26.36■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 NCAPD2Q15021 1401 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.34■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.33■■□□□ 1.81
ODC1-202ENST00000405333 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
ODC1-202ENST00000405333 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ODC1-202ENST00000405333 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
ODC1-202ENST00000405333 MCM10Q7L590 875 aa26.3■■□□□ 1.8
ODC1-202ENST00000405333 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.3■■□□□ 1.8
ODC1-202ENST00000405333 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
ODC1-202ENST00000405333 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.27■■□□□ 1.8
ODC1-202ENST00000405333 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
ODC1-202ENST00000405333 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.26■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 STRN4Q9NRL3 753 aa26.26■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 ADAMTS2O95450 1211 aa26.26■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.26■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 IL16Q14005 1332 aa26.25■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.25■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.24■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 BTG4Q9NY30 223 aa26.24■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 MEGF6O75095 1541 aa26.24■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 710.8 ms