RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4B-204ENST00000402096 COL18A1P39060 1754 aa26.92■■□□□ 1.9
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ATG4B-204ENST00000402096 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
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ATG4B-204ENST00000402096 WDR63Q8IWG1 891 aa26.82■■□□□ 1.88
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ATG4B-204ENST00000402096 E9PSI1 815 aa26.82■■□□□ 1.88
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ATG4B-204ENST00000402096 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
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ATG4B-204ENST00000402096 NCAPD2Q15021 1401 aa26.75■■□□□ 1.87
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ATG4B-204ENST00000402096 DCTN1Q14203 1278 aa26.69■■□□□ 1.86
ATG4B-204ENST00000402096 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
ATG4B-204ENST00000402096 STRN4Q9NRL3 753 aa26.69■■□□□ 1.86
ATG4B-204ENST00000402096 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.68■■□□□ 1.86
ATG4B-204ENST00000402096 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ATG4B-204ENST00000402096 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ATG4B-204ENST00000402096 ADAMTS2O95450 1211 aa26.66■■□□□ 1.86
ATG4B-204ENST00000402096 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
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