RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399211.7

KRT17P1-201, Transcript of keratin 17 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene KRT17P1, Length 1,546 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17P1-201ENST00000399211 SOCS7O14512 581 aa28.25■■■□□ 2.11
KRT17P1-201ENST00000399211 CCDC7Q96M83 1385 aa28.24■■■□□ 2.11
KRT17P1-201ENST00000399211 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.24■■■□□ 2.11
KRT17P1-201ENST00000399211 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
KRT17P1-201ENST00000399211 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.23■■■□□ 2.11
KRT17P1-201ENST00000399211 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.23■■■□□ 2.11
KRT17P1-201ENST00000399211 EVA1CP58658 441 aa28.23■■■□□ 2.11
KRT17P1-201ENST00000399211 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.19■■■□□ 2.1
KRT17P1-201ENST00000399211 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
KRT17P1-201ENST00000399211 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.18■■■□□ 2.1
KRT17P1-201ENST00000399211 USP35Q9P2H5 1018 aa28.18■■■□□ 2.1
KRT17P1-201ENST00000399211 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.17■■■□□ 2.1
KRT17P1-201ENST00000399211 ABCC6O95255 1503 aa28.16■■■□□ 2.1
KRT17P1-201ENST00000399211 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.16■■■□□ 2.1
KRT17P1-201ENST00000399211 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
KRT17P1-201ENST00000399211 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.15■■■□□ 2.1
KRT17P1-201ENST00000399211 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.15■■■□□ 2.1
KRT17P1-201ENST00000399211 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 CRB1P82279 1406 aa28.13■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.12■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.12■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 A0A0G2JS52 829 aa28.11■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 MYT1Q01538 1121 aa28.11■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.1■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 PEAK1Q9H792 1746 aa28.1■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.09■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 IP6K1Q92551 441 aa28.09■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 ERBB3P21860 1342 aa28.09■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.08■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.08■■■□□ 2.09
KRT17P1-201ENST00000399211 HOXC9P31274 260 aa28.08■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 AMPHP49418 695 aa28.08■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.07■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 BARGINQ6ZT62 677 aa28.05■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.05■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 EP400Q96L91 3159 aa28.05■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.04■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 NSD2O96028 1365 aa28.03■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 RTL1A6NKG5 1358 aa28.03■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.02■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.02■■■□□ 2.08
KRT17P1-201ENST00000399211 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 NLRP2Q9NX02 1062 aa28■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 FAM182BQ5T319 152 aa27.98■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 MORC1Q86VD1 984 aa27.98■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 POLKQ9UBT6 870 aa27.98■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 FLT4P35916 1363 aa27.98■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 LRRC37A3O60309 1634 aa27.96■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 DISP2A7MBM2 1401 aa27.96■■■□□ 2.07
KRT17P1-201ENST00000399211 INSRP06213 1382 aa27.95■■■□□ 2.06
KRT17P1-201ENST00000399211 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.95■■■□□ 2.06
KRT17P1-201ENST00000399211 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.89■■■□□ 2.06
KRT17P1-201ENST00000399211 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.89■■■□□ 2.06
KRT17P1-201ENST00000399211 NBPF4Q96M43 638 aa27.89■■■□□ 2.06
KRT17P1-201ENST00000399211 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
KRT17P1-201ENST00000399211 PDE3BQ13370 1112 aa27.88■■■□□ 2.05
KRT17P1-201ENST00000399211 DDB1Q16531 1140 aa27.87■■■□□ 2.05
KRT17P1-201ENST00000399211 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.87■■■□□ 2.05
KRT17P1-201ENST00000399211 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
KRT17P1-201ENST00000399211 IL2RBP14784 551 aa27.85■■■□□ 2.05
KRT17P1-201ENST00000399211 MEGF6O75095 1541 aa27.82■■■□□ 2.04
KRT17P1-201ENST00000399211 TNS2Q63HR2 1409 aa27.82■■■□□ 2.04
KRT17P1-201ENST00000399211 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
KRT17P1-201ENST00000399211 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
KRT17P1-201ENST00000399211 EXOC5O00471 708 aa27.8■■■□□ 2.04
KRT17P1-201ENST00000399211 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
KRT17P1-201ENST00000399211 MTHFSP49914 203 aa27.78■■■□□ 2.04
KRT17P1-201ENST00000399211 EYA1Q99502 592 aa27.78■■■□□ 2.04
KRT17P1-201ENST00000399211 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.77■■■□□ 2.04
KRT17P1-201ENST00000399211 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.76■■■□□ 2.03
KRT17P1-201ENST00000399211 NCAPD2Q15021 1401 aa27.76■■■□□ 2.03
KRT17P1-201ENST00000399211 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.76■■■□□ 2.03
KRT17P1-201ENST00000399211 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
KRT17P1-201ENST00000399211 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.75■■■□□ 2.03
KRT17P1-201ENST00000399211 TRIM37O94972 964 aa27.74■■■□□ 2.03
KRT17P1-201ENST00000399211 SBF2Q86WG5 1849 aa27.74■■■□□ 2.03
KRT17P1-201ENST00000399211 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.72■■■□□ 2.03
KRT17P1-201ENST00000399211 CCDC125Q86Z20 511 aa27.72■■■□□ 2.03
KRT17P1-201ENST00000399211 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.72■■■□□ 2.03
KRT17P1-201ENST00000399211 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.69■■■□□ 2.02
KRT17P1-201ENST00000399211 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
KRT17P1-201ENST00000399211 IL13P35225 146 aa27.69■■■□□ 2.02
KRT17P1-201ENST00000399211 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
KRT17P1-201ENST00000399211 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
KRT17P1-201ENST00000399211 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms