RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369031.4

PDSS2-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS2, Length 1,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2-201ENST00000369031 RGS12O14924 1447 aa22.03■■□□□ 1.12
PDSS2-201ENST00000369031 RXRBP28702 533 aa22.02■■□□□ 1.12
PDSS2-201ENST00000369031 VPS72Q15906 364 aa22.02■■□□□ 1.12
PDSS2-201ENST00000369031 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.02■■□□□ 1.12
PDSS2-201ENST00000369031 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PDSS2-201ENST00000369031 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.02■■□□□ 1.12
PDSS2-201ENST00000369031 NSD2O96028 1365 aa22.01■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.98■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 EVA1CP58658 441 aa21.97■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.97■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.97■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.96■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.96■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 RTL1A6NKG5 1358 aa21.96■■□□□ 1.11
PDSS2-201ENST00000369031 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.95■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.95■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 CRB1P82279 1406 aa21.95■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 HOXC9P31274 260 aa21.94■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 AMPHP49418 695 aa21.94■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 MORC1Q86VD1 984 aa21.94■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 USP35Q9P2H5 1018 aa21.94■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.94■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 ERBB3P21860 1342 aa21.93■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.93■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 IP6K1Q92551 441 aa21.93■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.92■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 FLT4P35916 1363 aa21.91■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.91■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.9■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.89■■□□□ 1.1
PDSS2-201ENST00000369031 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 A0A0G2JS52 829 aa21.88■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 MYT1Q01538 1121 aa21.88■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 POLKQ9UBT6 870 aa21.88■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 LRRC37A3O60309 1634 aa21.88■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.87■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.87■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.86■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.86■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 INSRP06213 1382 aa21.86■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.85■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.84■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PDSS2-201ENST00000369031 DISP2A7MBM2 1401 aa21.82■■□□□ 1.08
PDSS2-201ENST00000369031 BARGINQ6ZT62 677 aa21.82■■□□□ 1.08
PDSS2-201ENST00000369031 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PDSS2-201ENST00000369031 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.79■■□□□ 1.08
PDSS2-201ENST00000369031 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.77■■□□□ 1.08
PDSS2-201ENST00000369031 NBPF4Q96M43 638 aa21.77■■□□□ 1.08
PDSS2-201ENST00000369031 MEGF6O75095 1541 aa21.76■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.75■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.75■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.75■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 MTHFSP49914 203 aa21.75■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.75■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 TNS2Q63HR2 1409 aa21.74■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 FAM182BQ5T319 152 aa21.74■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 NCAPD2Q15021 1401 aa21.73■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 SOCS7O14512 581 aa21.72■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 IL2RBP14784 551 aa21.72■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 EP400Q96L91 3159 aa21.72■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 PPP2R1AP30153 589 aa21.71■■□□□ 1.07
PDSS2-201ENST00000369031 DDB1Q16531 1140 aa21.7■■□□□ 1.06
PDSS2-201ENST00000369031 EYA1Q99502 592 aa21.7■■□□□ 1.06
PDSS2-201ENST00000369031 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PDSS2-201ENST00000369031 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.7■■□□□ 1.06
PDSS2-201ENST00000369031 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.69■■□□□ 1.06
PDSS2-201ENST00000369031 PDE3BQ13370 1112 aa21.68■■□□□ 1.06
PDSS2-201ENST00000369031 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.68■■□□□ 1.06
PDSS2-201ENST00000369031 IL13P35225 146 aa21.66■■□□□ 1.06
PDSS2-201ENST00000369031 SBF2Q86WG5 1849 aa21.66■■□□□ 1.06
PDSS2-201ENST00000369031 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PDSS2-201ENST00000369031 EXOC5O00471 708 aa21.64■■□□□ 1.05
PDSS2-201ENST00000369031 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.64■■□□□ 1.05
PDSS2-201ENST00000369031 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PDSS2-201ENST00000369031 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.64■■□□□ 1.05
PDSS2-201ENST00000369031 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
PDSS2-201ENST00000369031 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PDSS2-201ENST00000369031 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
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