RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 DIXDC1Q155Q3 683 aa3.68□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa3.68□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 WNK3Q9BYP7 1800 aa3.68□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa3.68□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 PIK3R5Q8WYR1 880 aa3.68□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa3.68□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 PRAG1Q86YV5 1406 aa3.68□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 NEURL4Q96JN8 1562 aa3.68□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 C2orf72A6NCS6 295 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 NPR3P17342 541 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 SOX11P35716 441 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 PIK3C2BO00750 1634 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 VWDEQ8N2E2 1590 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 GRIN2BQ13224 1484 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 DPY19L2Q6NUT2 758 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 LAMB1P07942 1786 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHD1A6NEE1 506 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 PHTF2Q8N3S3 785 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 PTK7Q13308 1070 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 OCLNQ16625 522 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 BCL2L13Q9BXK5 485 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 KIF21BO75037 1637 aa3.67□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD33BA6NCL7 494 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 FAM196BA6NMK8 535 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 EVI5O60447 810 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 IQGAP3Q86VI3 1631 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 CDH23Q9H251 3354 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 CLCN6P51797 869 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 SPACA7Q96KW9 195 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 HECW1Q76N89 1606 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 KDM4AO75164 1064 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 OATP04181 439 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 PIP4P2Q8N4L2 257 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 DDX12PQ92771 950 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 ASB16Q96NS5 453 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 LNPKQ9C0E8 428 aa3.66□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP4P98171 946 aa3.65□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 VAC14Q08AM6 782 aa3.65□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 EPAS1Q99814 870 aa3.65□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 PIF1Q9H611 641 aa3.65□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 EPS8L1Q8TE68 723 aa3.65□□□□□ -1.82
CCSAP-202ENST00000366686 MADDQ8WXG6 1647 aa3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 MOXD2PA6NHM9 499 aa3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 CHRDL2Q6WN34 429 aa3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 GIPC2Q8TF65 315 aa3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 FAM198AQ9UFP1 575 aa3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGC3Q9UN70 934 aa3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 MARCH6O60337 910 aa3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 RFX1P22670 979 aa3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 PPME1Q9Y570 386 aa3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 KDM5DQ9BY66 1539 aa3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 C3orf80F5H4A9 247 aa3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 FAM161AQ3B820 660 aa3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFV2P19404 249 aa3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 NLRP7Q8WX94 980 aa3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 LAMA5O15230 3695 aa3.64□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 MARSP56192 900 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 TICAM2Q86XR7 235 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 RNF135Q8IUD6 432 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 KCNB2Q92953 911 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 NLRP2Q9NX02 1062 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 FGD5Q6ZNL6 1462 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 CTDSPL2Q05D32 466 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 MYO3AQ8NEV4 1616 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 RAB11FIP3O75154 756 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 NCLP19338 710 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 MAP3K9P80192 1104 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 WWC1Q8IX03 1113 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 ABCA3Q99758 1704 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 UTRNP46939 3433 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD62A6NC57 917 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 DSC3Q14574 896 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms