RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAH3Q8TD57 4116 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WNK1Q9H4A3 2382 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SHISA8B8ZZ34 492 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAF4O00268 1085 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PKHD1P08F94 4074 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C17orf51A8MQB3 221 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRRM5B3KS81 715 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC188H7C350 402 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 THBS1P07996 1170 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGL3Q3MIN7 710 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XKR6Q5GH73 641 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MGAQ8IWI9 3026 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EYSQ5T1H1 3165 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EP400Q96L91 3159 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EPM2AB3EWF7 344 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LTKP29376 864 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GSK3AP49840 483 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM161AQ3B820 660 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C3orf36Q3SXR2 165 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRIP2Q9C0E4 1043 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERGEFQ9UGK8 458 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MUC4Q99102 2169 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRB1P04280 392 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT5P13647 590 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XGP55808 180 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WFDC3Q8IUB2 231 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGFBPL1Q8WX77 278 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZDHHC16Q969W1 377 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SORL1Q92673 2214 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRBAP50851 2863 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ERVV-2B6SEH9 535 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COMPP49747 757 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DGKQP52824 942 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XKR4Q5GH76 650 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LELP1Q5T871 98 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LOC400499M0QZD8 3231 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CARNS1A5YM72 827 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WASLO00401 505 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAS8-AS1O95177 125 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USP51Q70EK9 711 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAS2L2Q8NHY3 880 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNED1Q8TER0 1413 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLXNB1O43157 2135 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL1A2P08123 1366 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MEGF11A6BM72 1044 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLAURQ03405 335 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POTEGQ6S5H5 508 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PP632Q6XCG6 107 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM214BQ7L5A3 538 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKX2-3Q8TAU0 364 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PANK1Q8TE04 598 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KDM4CQ9H3R0 1056 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF358Q9NW07 568 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIOO75962 3097 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPEGQ15772 3267 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUV39H1O43463 412 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT3P12035 628 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 INHBCP55103 352 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WASF2Q9Y6W5 498 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAH2Q9P225 4427 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CENPEQ02224 2701 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAMTS2O95450 1211 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT81Q14533 505 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC157Q569K6 752 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OAFQ86UD1 273 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSRNP1Q96S65 589 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRR12Q9ULL5 1215 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F8P00451 2351 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CBLBQ13191 982 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCARF1Q14162 830 aa-1.69□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms