RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 FBLN1P23142 703 aa36.51■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 NRAPQ86VF7 1730 aa36.51■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 VPS72Q15906 364 aa36.5■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 ATRNO75882 1429 aa36.5■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 MAP3K19Q56UN5 1328 aa36.49■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 AXIN2Q9Y2T1 843 aa36.49■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 AMPHP49418 695 aa36.48■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 RXRBP28702 533 aa36.47■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 IP6K1Q92551 441 aa36.47■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 STRN4Q9NRL3 753 aa36.47■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CRIP1-201ENST00000330233 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
CRIP1-201ENST00000330233 KIF24Q5T7B8 1368 aa36.43■■■■□ 3.42
CRIP1-201ENST00000330233 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
CRIP1-201ENST00000330233 RTL1A6NKG5 1358 aa36.41■■■■□ 3.42
CRIP1-201ENST00000330233 HOXC9P31274 260 aa36.41■■■■□ 3.42
CRIP1-201ENST00000330233 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
CRIP1-201ENST00000330233 POLKQ9UBT6 870 aa36.38■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.37■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.37■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa36.36■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa36.36■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 WDR17Q8IZU2 1322 aa36.36■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 FLT4P35916 1363 aa36.35■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.34■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD24Q8TF21 1146 aa36.34■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.33■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 ERBB3P21860 1342 aa36.33■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 CRB1P82279 1406 aa36.32■■■■□ 3.41
CRIP1-201ENST00000330233 PEAK1Q9H792 1746 aa36.31■■■■□ 3.4
CRIP1-201ENST00000330233 GLI3P10071 1580 aa36.31■■■■□ 3.4
CRIP1-201ENST00000330233 INSRP06213 1382 aa36.31■■■■□ 3.4
CRIP1-201ENST00000330233 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa36.3■■■■□ 3.4
CRIP1-201ENST00000330233 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
CRIP1-201ENST00000330233 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
CRIP1-201ENST00000330233 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
CRIP1-201ENST00000330233 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.28■■■■□ 3.4
CRIP1-201ENST00000330233 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
CRIP1-201ENST00000330233 CARD10Q9BWT7 1032 aa36.28■■■■□ 3.4
CRIP1-201ENST00000330233 USP35Q9P2H5 1018 aa36.28■■■■□ 3.4
CRIP1-201ENST00000330233 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
CRIP1-201ENST00000330233 NLRP2Q9NX02 1062 aa36.25■■■■□ 3.39
CRIP1-201ENST00000330233 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
CRIP1-201ENST00000330233 BARGINQ6ZT62 677 aa36.24■■■■□ 3.39
CRIP1-201ENST00000330233 MTHFSP49914 203 aa36.22■■■■□ 3.39
CRIP1-201ENST00000330233 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
CRIP1-201ENST00000330233 ILDR2Q71H61 639 aa36.21■■■■□ 3.39
CRIP1-201ENST00000330233 RALBP1Q15311 655 aa36.17■■■■□ 3.38
CRIP1-201ENST00000330233 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.17■■■■□ 3.38
CRIP1-201ENST00000330233 RGPD2P0DJD1 1756 aa36.17■■■■□ 3.38
CRIP1-201ENST00000330233 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.16■■■■□ 3.38
CRIP1-201ENST00000330233 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
CRIP1-201ENST00000330233 RGS12O14924 1447 aa36.16■■■■□ 3.38
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0G2JS52 829 aa36.15■■■■□ 3.38
CRIP1-201ENST00000330233 MYT1Q01538 1121 aa36.15■■■■□ 3.38
CRIP1-201ENST00000330233 PPP2R1AP30153 589 aa36.13■■■■□ 3.37
CRIP1-201ENST00000330233 NBPF6Q5VWK0 638 aa36.12■■■■□ 3.37
CRIP1-201ENST00000330233 NBPF4Q96M43 638 aa36.12■■■■□ 3.37
CRIP1-201ENST00000330233 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
CRIP1-201ENST00000330233 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36.1■■■■□ 3.37
CRIP1-201ENST00000330233 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.09■■■■□ 3.37
CRIP1-201ENST00000330233 WNK3Q9BYP7 1800 aa36.09■■■■□ 3.37
CRIP1-201ENST00000330233 IL2RBP14784 551 aa36.07■■■■□ 3.36
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP53Q96M91 514 aa36.07■■■■□ 3.36
CRIP1-201ENST00000330233 EYA1Q99502 592 aa36.06■■■■□ 3.36
CRIP1-201ENST00000330233 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CRIP1-201ENST00000330233 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
CRIP1-201ENST00000330233 IL13P35225 146 aa36.03■■■■□ 3.36
CRIP1-201ENST00000330233 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.03■■■■□ 3.36
CRIP1-201ENST00000330233 DISP2A7MBM2 1401 aa36.02■■■■□ 3.36
CRIP1-201ENST00000330233 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
CRIP1-201ENST00000330233 EXOC5O00471 708 aa36.01■■■■□ 3.35
CRIP1-201ENST00000330233 DDB1Q16531 1140 aa36.01■■■■□ 3.35
CRIP1-201ENST00000330233 USHBP1Q8N6Y0 703 aa36.01■■■■□ 3.35
CRIP1-201ENST00000330233 PDE3BQ13370 1112 aa36■■■■□ 3.35
CRIP1-201ENST00000330233 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa35.99■■■■□ 3.35
CRIP1-201ENST00000330233 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
CRIP1-201ENST00000330233 IGSF1Q8N6C5 1336 aa35.97■■■■□ 3.35
CRIP1-201ENST00000330233 NCAPD2Q15021 1401 aa35.97■■■■□ 3.35
CRIP1-201ENST00000330233 TATP17735 454 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
CRIP1-201ENST00000330233 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC37A3O60309 1634 aa35.92■■■■□ 3.34
CRIP1-201ENST00000330233 NUDCQ9Y266 331 aa35.92■■■■□ 3.34
CRIP1-201ENST00000330233 RGPD1P0DJD0 1748 aa35.92■■■■□ 3.34
CRIP1-201ENST00000330233 ANP32CO43423 234 aa35.91■■■■□ 3.34
CRIP1-201ENST00000330233 SULT6B1Q6IMI4 303 aa35.88■■■■□ 3.33
CRIP1-201ENST00000330233 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
CRIP1-201ENST00000330233 MEGF6O75095 1541 aa35.88■■■■□ 3.33
CRIP1-201ENST00000330233 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa35.87■■■■□ 3.33
CRIP1-201ENST00000330233 TNS2Q63HR2 1409 aa35.87■■■■□ 3.33
CRIP1-201ENST00000330233 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
CRIP1-201ENST00000330233 FAM196AQ6ZSG2 479 aa35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms