RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC71-201ENST00000321895 FAM83GA6ND36 823 aa25.86■■□□□ 1.73
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CCDC71-201ENST00000321895 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.82■■□□□ 1.72
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CCDC71-201ENST00000321895 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.8■■□□□ 1.72
CCDC71-201ENST00000321895 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.79■■□□□ 1.72
CCDC71-201ENST00000321895 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.78■■□□□ 1.72
CCDC71-201ENST00000321895 E9PSI1 815 aa25.78■■□□□ 1.72
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CCDC71-201ENST00000321895 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
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CCDC71-201ENST00000321895 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.76■■□□□ 1.71
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CCDC71-201ENST00000321895 ADAMTS2O95450 1211 aa25.76■■□□□ 1.71
CCDC71-201ENST00000321895 EVA1CP58658 441 aa25.76■■□□□ 1.71
CCDC71-201ENST00000321895 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
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CCDC71-201ENST00000321895 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.74■■□□□ 1.71
CCDC71-201ENST00000321895 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CCDC71-201ENST00000321895 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.74■■□□□ 1.71
CCDC71-201ENST00000321895 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.74■■□□□ 1.71
CCDC71-201ENST00000321895 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.74■■□□□ 1.71
CCDC71-201ENST00000321895 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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CCDC71-201ENST00000321895 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
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