RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299339.2

CLDN10-201, Transcript of claudin 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN10, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10-201ENST00000299339 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 LAMC1P11047 1609 aa10.06□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 NOS1P29475 1434 aa10.06□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa10.06□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 RIMS2Q9UQ26 1411 aa10.06□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 PIK3R4Q99570 1358 aa10.05□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 TRPM2O94759 1503 aa10.05□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.05□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 PTPN5P54829 565 aa10.04□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF454Q8N9F8 522 aa10.04□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 ERBINQ96RT1 1412 aa10.04□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 GLI3P10071 1580 aa10.04□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10.04□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 PTPRUQ92729 1446 aa10.03□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 CFAP44Q96MT7 982 aa10.03□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.03□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 KANK1Q14678 1352 aa10.02□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.02□□□□□ -0.8
CLDN10-201ENST00000299339 RGS20O76081 388 aa10.02□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 FOSBP53539 338 aa10.02□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.02□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.02□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 HDGFP51858 240 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 THSD4Q6ZMP0 1018 aa10.01□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.01□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 KIF15Q9NS87 1388 aa10.01□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 CROCC2H7BZ55 1655 aa10□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa10□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 ZBED2Q9BTP6 218 aa10□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 MYOM2P54296 1465 aa9.99□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.99□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 PTPREP23469 700 aa9.98□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 BAG6P46379 1132 aa9.98□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.98□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.97□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 PDE4AP27815 886 aa9.97□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 PLCB2Q00722 1185 aa9.97□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.97□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.96□□□□□ -0.81
CLDN10-201ENST00000299339 A0A0G2JS52 829 aa9.96□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.95□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.95□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.95□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.95□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.95□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 SLIT2O94813 1529 aa9.94□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.94□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.94□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 WNT2BQ93097 391 aa9.94□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.93□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.93□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.92□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 EVI5O60447 810 aa9.92□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.92□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 ORAI2Q96SN7 254 aa9.92□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.91□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 C1QTNF8P60827 252 aa9.91□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 MFSD10Q14728 455 aa9.91□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 USP32Q8NFA0 1604 aa9.9□□□□□ -0.82
CLDN10-201ENST00000299339 PXDNQ92626 1479 aa9.9□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.9□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 DISP2A7MBM2 1401 aa9.9□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 ABCC5O15440 1437 aa9.9□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 NBPF3Q9H094 633 aa9.89□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.89□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 METP08581 1390 aa9.88□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.88□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 CHD4Q14839 1912 aa9.88□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 VPS72Q15906 364 aa9.88□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 RREB1Q92766 1687 aa9.87□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 ADGRB2O60241 1585 aa9.87□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.87□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 E9PCH4 1651 aa9.87□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.86□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 ADGRL2O95490 1459 aa9.86□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 DAPK1P53355 1430 aa9.85□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.85□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CLDN10-201ENST00000299339 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms