RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-201ENST00000298838 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 CERKQ8TCT0 537 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 IP6K1Q92551 441 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 PHLPP1O60346 1717 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCA3Q99758 1704 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 PIP4K2BP78356 416 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 FCHSD2O94868 740 aa27.43■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 APAF1O14727 1248 aa27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC6O95255 1503 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-201ENST00000298838 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.39■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 HMOX1P09601 288 aa27.39■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 NGEFQ8N5V2 710 aa27.39■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 CPDO75976 1380 aa27.38■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 NEFMP07197 916 aa27.37■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 PRKAR2BP31323 418 aa27.37■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.37■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA0232Q92628 1395 aa27.35■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.35■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 COL18A1P39060 1754 aa27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 RGPD5Q99666 1765 aa27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 EYA1Q99502 592 aa27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3-201ENST00000298838 KDRP35968 1356 aa27.32■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.32■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE3BQ13370 1112 aa27.3■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.3■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 NEUROD2Q15784 382 aa27.29■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.29■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.29■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF521Q96K83 1311 aa27.28■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.27■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 CHRNA2Q15822 529 aa27.27■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 ERBB3P21860 1342 aa27.27■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PACSIN3-201ENST00000298838 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC27Q2M243 656 aa27.26■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.26■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.25■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.25■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.24■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 NBPF4Q96M43 638 aa27.24■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 WWC1Q8IX03 1113 aa27.23■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 NFE2L2Q16236 605 aa27.22■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 NCAPD2Q15021 1401 aa27.22■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA2Q08379 1002 aa27.21■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 RIPK4P57078 832 aa27.2■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.2■■□□□ 1.95
PACSIN3-201ENST00000298838 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.19■■□□□ 1.94
PACSIN3-201ENST00000298838 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.18■■□□□ 1.94
PACSIN3-201ENST00000298838 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.18■■□□□ 1.94
PACSIN3-201ENST00000298838 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
PACSIN3-201ENST00000298838 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR63Q8IWG1 891 aa27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3-201ENST00000298838 JCADQ9P266 1359 aa27.15■■□□□ 1.94
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM83GA6ND36 823 aa27.15■■□□□ 1.94
PACSIN3-201ENST00000298838 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.15■■□□□ 1.94
PACSIN3-201ENST00000298838 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.14■■□□□ 1.94
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.13■■□□□ 1.93
PACSIN3-201ENST00000298838 E9PSI1 815 aa27.13■■□□□ 1.93
PACSIN3-201ENST00000298838 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.12■■□□□ 1.93
PACSIN3-201ENST00000298838 SLFN5Q08AF3 891 aa27.11■■□□□ 1.93
PACSIN3-201ENST00000298838 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PACSIN3-201ENST00000298838 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PACSIN3-201ENST00000298838 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.08■■□□□ 1.93
PACSIN3-201ENST00000298838 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.08■■□□□ 1.93
PACSIN3-201ENST00000298838 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTS2O95450 1211 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 EVA1CP58658 441 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 BTG4Q9NY30 223 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 IL16Q14005 1332 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 STRN4Q9NRL3 753 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.05■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.05■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPA1LP34931 641 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.03■■□□□ 1.92
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