RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 COL18A1P39060 1754 aa25.33■■□□□ 1.65
PTX4-201ENST00000293922 USP54Q70EL1 1684 aa25.32■■□□□ 1.64
PTX4-201ENST00000293922 BARGINQ6ZT62 677 aa25.32■■□□□ 1.64
PTX4-201ENST00000293922 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.32■■□□□ 1.64
PTX4-201ENST00000293922 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.3■■□□□ 1.64
PTX4-201ENST00000293922 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.3■■□□□ 1.64
PTX4-201ENST00000293922 CRB1P82279 1406 aa25.29■■□□□ 1.64
PTX4-201ENST00000293922 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTX4-201ENST00000293922 FAM182BQ5T319 152 aa25.29■■□□□ 1.64
PTX4-201ENST00000293922 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PTX4-201ENST00000293922 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.27■■□□□ 1.64
PTX4-201ENST00000293922 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.27■■□□□ 1.64
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.26■■□□□ 1.63
PTX4-201ENST00000293922 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.25■■□□□ 1.63
PTX4-201ENST00000293922 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.25■■□□□ 1.63
PTX4-201ENST00000293922 CCDC7Q96M83 1385 aa25.25■■□□□ 1.63
PTX4-201ENST00000293922 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.24■■□□□ 1.63
PTX4-201ENST00000293922 ABCC6O95255 1503 aa25.24■■□□□ 1.63
PTX4-201ENST00000293922 CDCA8Q53HL2 280 aa25.23■■□□□ 1.63
PTX4-201ENST00000293922 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.23■■□□□ 1.63
PTX4-201ENST00000293922 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PTX4-201ENST00000293922 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.22■■□□□ 1.63
PTX4-201ENST00000293922 RGPD5Q99666 1765 aa25.21■■□□□ 1.63
PTX4-201ENST00000293922 PDE3BQ13370 1112 aa25.19■■□□□ 1.62
PTX4-201ENST00000293922 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTX4-201ENST00000293922 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.18■■□□□ 1.62
PTX4-201ENST00000293922 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.17■■□□□ 1.62
PTX4-201ENST00000293922 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.17■■□□□ 1.62
PTX4-201ENST00000293922 LTN1O94822 1766 aa25.16■■□□□ 1.62
PTX4-201ENST00000293922 COG3Q96JB2 828 aa25.16■■□□□ 1.62
PTX4-201ENST00000293922 MYOM1P52179 1685 aa25.15■■□□□ 1.62
PTX4-201ENST00000293922 ERBB3P21860 1342 aa25.15■■□□□ 1.62
PTX4-201ENST00000293922 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.14■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 FYB1O15117 783 aa25.13■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 BAG6P46379 1132 aa25.13■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 LRRC37A3O60309 1634 aa25.13■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 DISP2A7MBM2 1401 aa25.12■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 TRIM37O94972 964 aa25.12■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.11■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 FBLN1P23142 703 aa25.11■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 DDB1Q16531 1140 aa25.11■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.11■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.11■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.1■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 IP6K1Q92551 441 aa25.1■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.1■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.09■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PTX4-201ENST00000293922 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.07■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.07■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.07■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 PEAK1Q9H792 1746 aa25.06■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 HOXC9P31274 260 aa25.03■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.03■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 APBA3O96018 575 aa25.03■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 AMPHP49418 695 aa25.02■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.02■■□□□ 1.6
PTX4-201ENST00000293922 TNS2Q63HR2 1409 aa25.01■■□□□ 1.59
PTX4-201ENST00000293922 EXOC5O00471 708 aa25.01■■□□□ 1.59
PTX4-201ENST00000293922 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PTX4-201ENST00000293922 RTL1A6NKG5 1358 aa25.01■■□□□ 1.59
PTX4-201ENST00000293922 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PTX4-201ENST00000293922 BCL9O00512 1426 aa24.99■■□□□ 1.59
PTX4-201ENST00000293922 IL2RBP14784 551 aa24.99■■□□□ 1.59
PTX4-201ENST00000293922 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.97■■□□□ 1.59
PTX4-201ENST00000293922 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PTX4-201ENST00000293922 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.96■■□□□ 1.59
PTX4-201ENST00000293922 SBF2Q86WG5 1849 aa24.95■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.95■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 PANK3Q9H999 370 aa24.95■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.92■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 FLT4P35916 1363 aa24.91■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.91■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 RREB1Q92766 1687 aa24.91■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 INSRP06213 1382 aa24.91■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.9■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.89■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 NBPF4Q96M43 638 aa24.89■■□□□ 1.58
PTX4-201ENST00000293922 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.89■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 PLSCR1O15162 318 aa24.88■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.86■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 MEGF6O75095 1541 aa24.86■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 KCNQ2O43526 872 aa24.86■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.85■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.85■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.84■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.83■■□□□ 1.57
PTX4-201ENST00000293922 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
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