RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292393.9

ZNF3-201, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF3, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-201ENST00000292393 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ZNF3-201ENST00000292393 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF3-201ENST00000292393 NGEFQ8N5V2 710 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF3-201ENST00000292393 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF3-201ENST00000292393 PHLPP1O60346 1717 aa16.09■□□□□ 0.17
ZNF3-201ENST00000292393 FCHSD2O94868 740 aa16.09■□□□□ 0.17
ZNF3-201ENST00000292393 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ZNF3-201ENST00000292393 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.08■□□□□ 0.17
ZNF3-201ENST00000292393 ABCA3Q99758 1704 aa16.08■□□□□ 0.17
ZNF3-201ENST00000292393 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 PIP4K2BP78356 416 aa16.07■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 RUNDC1Q96C34 613 aa16.07■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 KDRP35968 1356 aa16.05■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.05■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.05■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.05■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.05■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 KIAA0232Q92628 1395 aa16.04■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 COL18A1P39060 1754 aa16.04■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 NCAPD2Q15021 1401 aa16.02■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.02■□□□□ 0.16
ZNF3-201ENST00000292393 LMO7Q8WWI1 1683 aa16.02■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 ERBB3P21860 1342 aa16.01■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 APAF1O14727 1248 aa16.01■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 EYA1Q99502 592 aa16.01■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.01■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 JCADQ9P266 1359 aa16■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 NEFMP07197 916 aa16■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 PRKAR2BP31323 418 aa16■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 CCDC27Q2M243 656 aa16■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 SULT6B1Q6IMI4 303 aa16■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 PRDM11Q9NQV5 511 aa16■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa16■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.99■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 PLEKHG5O94827 1062 aa15.99■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 HMOX1P09601 288 aa15.99■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 PDE3BQ13370 1112 aa15.99■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF521Q96K83 1311 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 CHRNA2Q15822 529 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 NBPF4Q96M43 638 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF3-201ENST00000292393 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 NFE2L2Q16236 605 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 FAM83GA6ND36 823 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 PHACTR3Q96KR7 559 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 RGPD5Q99666 1765 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 WDR63Q8IWG1 891 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 WWC1Q8IX03 1113 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.91■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.91■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 HSPA1LP34931 641 aa15.9■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 RIPK4P57078 832 aa15.9■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 GOLGA2Q08379 1002 aa15.9■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 GAS2L2Q8NHY3 880 aa15.9■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
ZNF3-201ENST00000292393 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 IL16Q14005 1332 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 CRB1P82279 1406 aa15.88■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 NEUROD2Q15784 382 aa15.88■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 BTG4Q9NY30 223 aa15.88■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 SLIT2O94813 1529 aa15.88■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.88■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.87■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 PLCH1Q4KWH8 1693 aa15.87■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.87■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 E9PSI1 815 aa15.87■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 EVA1CP58658 441 aa15.86■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 SLFN5Q08AF3 891 aa15.86■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.86■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 NRAPQ86VF7 1730 aa15.85■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 ADAMTS2O95450 1211 aa15.85■□□□□ 0.13
ZNF3-201ENST00000292393 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms