RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
USP3-201ENST00000268049 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP3-201ENST00000268049 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.5□□□□□ -0.89
USP3-201ENST00000268049 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP3-201ENST00000268049 TBX22Q9Y458 520 aa9.5□□□□□ -0.89
USP3-201ENST00000268049 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.5□□□□□ -0.89
USP3-201ENST00000268049 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
USP3-201ENST00000268049 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.5□□□□□ -0.89
USP3-201ENST00000268049 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
USP3-201ENST00000268049 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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USP3-201ENST00000268049 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.48□□□□□ -0.89
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USP3-201ENST00000268049 DDB1Q16531 1140 aa9.47□□□□□ -0.89
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USP3-201ENST00000268049 CCDC66A2RUB6 948 aa9.46□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 TPM2P07951 284 aa9.46□□□□□ -0.9
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USP3-201ENST00000268049 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa9.44□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.44□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 RIPK4P57078 832 aa9.44□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 GPS2Q13227 327 aa9.44□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.44□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.44□□□□□ -0.9
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USP3-201ENST00000268049 PLIN1O60240 522 aa9.44□□□□□ -0.9
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USP3-201ENST00000268049 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.44□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 WDR78Q5VTH9 848 aa9.43□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
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USP3-201ENST00000268049 FYB1O15117 783 aa9.43□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
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USP3-201ENST00000268049 ACEP12821 1306 aa9.42□□□□□ -0.9
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USP3-201ENST00000268049 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 WASHC4Q2M389 1173 aa9.42□□□□□ -0.9
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USP3-201ENST00000268049 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.41□□□□□ -0.9
USP3-201ENST00000268049 HOOK2Q96ED9 719 aa9.41□□□□□ -0.9
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